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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004130`

染色体: Chr08 坐标: 50190978-50192039 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004130`
名称	SmilChr08G004130
描述	uncharacterized SmilChr08G004130
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50190978 - 50192039 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998614`
GeneID	`130998614`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998614`
原始查询	`LOC130998614`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity); GO:0015074 (DNA integration)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF17921 (Integrase_H2C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998614

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780009.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780009.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780009.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780009.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780009.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50190997`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A16,A20,A25,A7,B111,B120,B121,B124,B128,B130,B131,B139,B15,B26,B28,B3,B30,B32,B35,B44,B45,B63,B64,B75,C22,C24,C32,C46,C56,C68,C73,C76,C84,D3
`Chr8:50191000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr8:50191020`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A19,A2,A24,A7,B126,B137,B46,B71,B80,C2,C25,C43,C47,C53,C87,D10
`Chr8:50191031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr8:50191047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:50191105`	`TC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B107,C22,D2
`Chr8:50191111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B62,C49
`Chr8:50191139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B56,B62,C16,C27,C49,C50,C62,C80,D3
`Chr8:50191149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B89,C43
`Chr8:50191157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B89,C43
`Chr8:50191170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B90,B92
`Chr8:50191172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780009.1

353 aa

176

353

RVT_3

Integrase_H2C2

PF13456 RVT_3 54-165 aa PF17921 Integrase_H2C2 255-302 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780009.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	54	165	5.7e-13	49.6	Reverse transcriptase-like
`XP_057780009.1`	Pfam	`PF17921`	Integrase_H2C2	Domain	255	302	1.3e-10	42.0	Integrase zinc binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924026.1
ATGGTCAAGTGGGCCGTGGAATTGGGGGAATATGACGTAGAGTATGAGCCGAGAACGGCAATCAAAGCACAAGCTCTTGCGGATTTCATCCAAGAAACCACTCGACGACCTGTGCAAGAATTTTGGATCACTTTTGTCGATGGGTCGGTAACAAAGGAAGGGTGCGGAATTGGGGAGTACATCATCTCCCCAAGCTATGGGATATATCAGTTTGCTATCAAGTTCACTTGCAGGATGTCCAACAATGAGACCGAGTATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998614
ATGGTCAAGTGGGCCGTGGAATTGGGGGAATATGACGTAGAGTATGAGCCGAGAACGGCAATCAAAGCACAAGCTCTTGCGGATTTCATCCAAGAAACCACTCGACGACCTGTGCAAGAATTTTGGATCACTTTTGTCGATGGGTCGGTAACAAAGGAAGGGTGCGGAATTGGGGAGTACATCATCTCCCCAAGCTATGGGATATATCAGTTTGCTATCAAGTTCACTTGCAGGATGTCCAACAATGAGACCGAGTATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780009.1
MVKWAVELGEYDVEYEPRTAIKAQALADFIQETTRRPVQEFWITFVDGSVTKEGCGIGEYIISPSYGIYQFAIKFTCRMSNNETEYEVVVRGAHILSELRAECVIIRTDSQLVAQQFLGECHIKEDRMRAYYNKINEMKAKFMEFKIEQISREENTKADLLARMASAVEQTWNDEIILLCDTREMRTSQVFSVEIRDDWRAPTMHFLKTGERLSKESNQRARYENYCLINDQLYKRSFTHPLLKCLSPDEADFALKEIHA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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