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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004148`

染色体: Chr08 坐标: 50667344-50668441 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004148`
名称	SmilChr08G004148
描述	uncharacterized SmilChr08G004148
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50667344 - 50668441 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998624`
GeneID	`130998624`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998624`
原始查询	`LOC130998624`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=22.9; qcov=1.09; evalue=1.21e-12; confidence=weak
Rice	`Os01g0967700` - identity=33.3; qcov=0.259; evalue=3.06e-06; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998624

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057780019.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057780019.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057780019.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057780019.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780019.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50667347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	B1,B117,B123,B130,B18,B19,B22,B29,B30,B37,B63,B72,B75,B8,B87,B9,B92,B98,C15,C37,C42,C45,C50,C51,C57,C7
`Chr8:50667350`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A13,B103,B118,B125,B128,B72,C17,C58,C83,D9
`Chr8:50667360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr8:50667368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,D8
`Chr8:50667403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,B76,D6
`Chr8:50667404`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A8,B101,B26,B97,C18
`Chr8:50667404`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A8,B101,B26,B97,C18
`Chr8:50667406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B35,C57
`Chr8:50667417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr8:50667455`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B46,C76,D11,D8
`Chr8:50667464`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B54,B99,C87,C9
`Chr8:50667482`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	49	A1,A19,A21,A23,A24,A6,B110,B112,B114,B118,B124,B132,B135,B136,B15,B2,B21,B3,B31,B38,B39,B47,B5,B51,B55,B59,B63,B65,B66,B82,B89,B97,C2,C27,C3,C35,C47,C48,C5,C52,C55,C56,C64,C66,C7,C82,C86,C9,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780019.1

347 aa

174

347

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 24-111 aa PF13456 RVT_3 207-321 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780019.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	24	111	1.2e-15	58.7	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057780019.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	207	321	2.3e-15	57.3	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924036.1
ATGCGAACCCCTATTGCTGAGCTTGGGCTGGAAGATACCATGTGCTGGAATTTTGATCCGCGGGGAGTGTTCTCGGTGAAGACGGCTTATCTGCTGAGTTTGGGATATTATGAGAATAATCCGAATCAAAGCTGGTCTCGTTTAGTTTGGAGCAATTCCCTTCCGCCAAAGATTAAAGTCTTTGTTTGGCGAGCTCTGAACAATATCATTCCAACGGGCGCTAATTTGAAAGAGCATAAGGTACCGATTGATGGAATTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998624
ATGCGAACCCCTATTGCTGAGCTTGGGCTGGAAGATACCATGTGCTGGAATTTTGATCCGCGGGGAGTGTTCTCGGTGAAGACGGCTTATCTGCTGAGTTTGGGATATTATGAGAATAATCCGAATCAAAGCTGGTCTCGTTTAGTTTGGAGCAATTCCCTTCCGCCAAAGATTAAAGTCTTTGTTTGGCGAGCTCTGAACAATATCATTCCAACGGGCGCTAATTTGAAAGAGCATAAGGTACCGATTGATGGAATTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780019.1
MRTPIAELGLEDTMCWNFDPRGVFSVKTAYLLSLGYYENNPNQSWSRLVWSNSLPPKIKVFVWRALNNIIPTGANLKEHKVPIDGIRGRCHSRWDVTEHSLIFCPVVHNTWKSFIFWRVLKEAVALPILAIAELIRRNFSVDEYTLWCMLLWRVWSFVCEVIHGKVQLESAPSAAESQTALEAFWAAKSTFFVKNIMGMRLGNRDPQRQQYGVRVAVRNHRGELQLAAAKACKASSNSLMMEIMAMVAGITWCLEYDISP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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