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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004162`

染色体: Chr08 坐标: 50921707-50923029 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004162`
名称	SmilChr08G004162
描述	uncharacterized SmilChr08G004162
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50921707 - 50923029 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998628`
GeneID	`130998628`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998628`
原始查询	`LOC130998628`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=36; qcov=0.391; evalue=1.97e-28; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid); PF08284 (RVP_2); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998628

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780022.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057780022.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057780022.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057780022.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780022.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50921710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:50921714`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A2,A22,A4,A5,A9,B117,B123,B14,B32,B46,B71,B99,C1,C39,C43,C58,C60,C61,C84,C85,D3
`Chr8:50921728`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B114,D11
`Chr8:50921728`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B114,D11
`Chr8:50921743`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A8,B84
`Chr8:50921743`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A8,B84
`Chr8:50921744`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A8,B84
`Chr8:50921744`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A8,B84
`Chr8:50921750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr8:50921762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:50921785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr8:50921790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B55,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780022.1

440 aa

220

440

PEG10_N-capsid

Ty3_capsid

RVP_2

PF03732 PEG10_N-capsid 78-151 aa PF19259 Ty3_capsid 91-237 aa PF08284 RVP_2 366-416 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780022.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	78	151	2.5e-09	38.1	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
`XP_057780022.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	91	237	4.9e-08	33.4	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057780022.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	366	416	5e-08	33.5	Retroviral aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924039.1
ATGGCCAGAACAAGGGGTAACAGGAGACCTCCGGCAGACGAAGAATCTGATAGCGAAGCCACTCAATCGATGGGGAATAGGAATCGAAATCAAAATGATGTTAATACGCTGGCCCACGTGCTTGCACAAGCACTGAGAGGAGTATTGCCTCAACAACCGCATCAACCTCAAGCAGAAGGTGGAAATGGAGTAGTAGCCCAATTTCGAAGCATGGCGCCACCAATTCTAAGGGGGAATGAAGGACCCTTAGGGACCGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998628
ATGGCCAGAACAAGGGGTAACAGGAGACCTCCGGCAGACGAAGAATCTGATAGCGAAGCCACTCAATCGATGGGGAATAGGAATCGAAATCAAAATGATGTTAATACGCTGGCCCACGTGCTTGCACAAGCACTGAGAGGAGTATTGCCTCAACAACCGCATCAACCTCAAGCAGAAGGTGGAAATGGAGTAGTAGCCCAATTTCGAAGCATGGCGCCACCAATTCTAAGGGGGAATGAAGGACCCTTAGGGACCGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780022.1
MARTRGNRRPPADEESDSEATQSMGNRNRNQNDVNTLAHVLAQALRGVLPQQPHQPQAEGGNGVVAQFRSMAPPILRGNEGPLGTEEWMRQMERIFNYMRCRDDSKVTCAAFQLIDDAGHWWESETASLTEEQVRAITWRTFKEKVMGKYFPKAFRKQKEIELMNLEQGNLTVLEYERKFTQLARFAPHLVDTDEKKAWRFENGLRPEIGGHLAALNITSYSEILERAQAVTSRLKLDNSVAQPQHTGEKRHWDDRDKMR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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