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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004165`

染色体: Chr08 坐标: 50960212-50960992 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004165`
名称	SmilChr08G004165
描述	uncharacterized SmilChr08G004165
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50960212 - 50960992 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998629`
GeneID	`130998629`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998629`
原始查询	`LOC130998629`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0629600` - identity=21.6; qcov=0.816; evalue=9.42e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998629

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057780023.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057780023.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780023.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780023.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780023.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50960241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr8:50960249`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	179	A10,A11,A13,A14,A15,A16,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B104,B105,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B117,B118,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B16,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B28,B3,B31,B33,B35,B38,B39,B4,B40,B41,B43,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B65,B66,B67,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B83,B84,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C25,C28,C29,C32,C33,C34,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C46,C48,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C66,C67,C68,C69,C70,C73,C74,C76,C77,C78,C80,C82,C83,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D6,D7,D9
`Chr8:50960255`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	172	A10,A11,A13,A14,A15,A16,A19,A2,A21,A22,A23,A25,A3,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B104,B105,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B117,B118,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B16,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B28,B3,B31,B33,B35,B39,B4,B40,B41,B43,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B54,B55,B57,B58,B6,B60,B62,B65,B66,B67,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B83,B84,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C25,C28,C29,C32,C33,C34,C36,C38,C39,C40,C41,C42,C43,C44,C46,C48,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C66,C67,C68,C69,C70,C73,C74,C76,C77,C78,C80,C82,C83,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D6,D9
`Chr8:50960296`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B112,B83,C18,C2,C45,C48,C59
`Chr8:50960341`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	50	A10,A15,A21,A7,B100,B103,B113,B114,B119,B128,B129,B13,B133,B135,B140,B18,B2,B20,B37,B4,B45,B47,B5,B51,B52,B59,B67,B69,B72,B85,B87,B90,B98,B99,C10,C13,C24,C34,C36,C4,C40,C42,C50,C51,C62,C75,C87,D7,D8,D9
`Chr8:50960344`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	51	A10,A15,A21,A7,B100,B103,B113,B114,B119,B126,B128,B129,B13,B133,B135,B140,B18,B2,B20,B37,B4,B45,B47,B5,B51,B52,B59,B67,B69,B72,B85,B87,B90,B98,B99,C10,C13,C24,C34,C36,C4,C40,C42,C50,C51,C62,C75,C87,D7,D8,D9
`Chr8:50960367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B139,B3,C77
`Chr8:50960431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B60,B62,B68
`Chr8:50960447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B102,B35,B46
`Chr8:50960452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,B95,C3
`Chr8:50960471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr8:50960475`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924040.1
ATGACTGTTACTCCGTTGTTGAATATTTTATCTGCTAAGCCGCTTACCGGTCCAAATTTTTTGGAATGGAAGCGCAATTTGGGATTTGTCCTAGACGCGAAAGAGTATAAGTTTGTGCTTACTACTCCAGCTCCTGCGAACCTAACTGCTCGGTCTTCCGAGGAGCAAAGGGAGGTTCACAAGCGGTGGCATAGGGCGAATAGTATGGCGAAAACCTACATGATGACCACTATGTCTTCCGCGTTGCAGCTGTATCATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998629
ATGACTGTTACTCCGTTGTTGAATATTTTATCTGCTAAGCCGCTTACCGGTCCAAATTTTTTGGAATGGAAGCGCAATTTGGGATTTGTCCTAGACGCGAAAGAGTATAAGTTTGTGCTTACTACTCCAGCTCCTGCGAACCTAACTGCTCGGTCTTCCGAGGAGCAAAGGGAGGTTCACAAGCGGTGGCATAGGGCGAATAGTATGGCGAAAACCTACATGATGACCACTATGTCTTCCGCGTTGCAGCTGTATCATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780023.1
MTVTPLLNILSAKPLTGPNFLEWKRNLGFVLDAKEYKFVLTTPAPANLTARSSEEQREVHKRWHRANSMAKTYMMTTMSSALQLYHQSKEIAAAIMKNLEELFGESDRSIRFELMRKLMSSKMTEGSSYVLGGSIAYDTKVDMILHTLSKSYENFHLNAVMGKKKFTLNELLNELVTAEGVMGKRPQALATDKGPSFALKGWKKQKGLYGKKGQAKSGCNKLGTSVGVGERKMLQVSASRTLEI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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