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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004183`

染色体: Chr08 坐标: 51253837-51254175 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004183`
名称	SmilChr08G004183
描述	putative RING-H2 finger protein ATL69
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51253837 - 51254175 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998635`
GeneID	`130998635`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998635`
原始查询	`LOC130998635`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative RING-H2 finger protein ATL69
产物	putative RING-H2 finger protein ATL69
Arabidopsis	`AT1G49210` (AT1G49210) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841344] identity=53.2; qcov=0.42; evalue=2.02e-12; confidence=low
Rice	`Os01g0311100` (OsRFPH2-4) - identity=50; qcov=0.411; evalue=9.86e-13; confidence=low
GO	GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0016740 (transferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF12678 (zf-rbx1); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998635

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057780031.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057780031.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057780031.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057780031.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780031.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51253893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B88,C81
`Chr8:51253902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,C18,C9
`Chr8:51253939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B121
`Chr8:51253943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C49,C80,C87,D3
`Chr8:51253966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr8:51253983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr8:51254020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B104
`Chr8:51254056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,C18,C44,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780031.1

112 aa

112

zf-RING_11

zf-C3HC4

zf-C3HC4_2

zf-RING_2

zf-rbx1

PF17123 zf-RING_11 66-94 aa PF00097 zf-C3HC4 66-107 aa PF13923 zf-C3HC4_2 66-107 aa PF13639 zf-RING_2 66-108 aa PF12678 zf-rbx1 78-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780031.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	66	94	1.2e-08	35.2	RING-like zinc finger
`XP_057780031.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	66	107	1.6e-07	31.8	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057780031.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	66	107	5e-07	30.1	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057780031.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	66	108	3.2e-12	47.2	Ring finger domain
`XP_057780031.1`	Pfam	`PF12678`	zf-rbx1	Domain	78	108	2.7e-07	31.5	RING-H2 zinc finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924048.1
ATGGAATTCTTCATCAAATGGTTTGCTGTAGGGGTTTTGATAGGAGCTGCAGTGTATCTCGTTTCTATTATGCTAGCTATTTGCTTTTGCTGTTTTTCAGACAGGAGTTGCATCGACATCCTATTTCCGAAGGCGGCCCCCGCTCCTATGGTGTTCGATACAGTCACCGGCAACGAAGGAGCGGACGACGGCGGCTGCGCCATCTGCCTCAGCGAGTACGCCGCCGGCGAGCGGCGCGCCACCATCTCCGAATGCAACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998635
ATGGAATTCTTCATCAAATGGTTTGCTGTAGGGGTTTTGATAGGAGCTGCAGTGTATCTCGTTTCTATTATGCTAGCTATTTGCTTTTGCTGTTTTTCAGACAGGAGTTGCATCGACATCCTATTTCCGAAGGCGGCCCCCGCTCCTATGGTGTTCGATACAGTCACCGGCAACGAAGGAGCGGACGACGGCGGCTGCGCCATCTGCCTCAGCGAGTACGCCGCCGGCGAGCGGCGCGCCACCATCTCCGAATGCAACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780031.1
MEFFIKWFAVGVLIGAAVYLVSIMLAICFCCFSDRSCIDILFPKAAPAPMVFDTVTGNEGADDGGCAICLSEYAAGERRATISECNHRFHALCIETWFQHKCTCPLCRHDLV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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