当前解析结果
SmilChr08G004229| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004229 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004229 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G004229 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 51702327 - 51702812 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998642 |
|---|---|
| GeneID | 130998642 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998642 |
| 原始查询 | LOC130998642 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998642 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057780040.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057780040.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780040.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780040.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057780040.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:51702338 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B105,B2,B25,C81 |
Chr8:51702338 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | B105,B2,B25,C81 |
Chr8:51702354 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,C77 |
Chr8:51702386 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,B115,B139,B47,C69 |
Chr8:51702395 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A9,B132 |
Chr8:51702413 |
ATT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | D11 |
Chr8:51702413 |
ATT |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr8:51702440 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C58 |
Chr8:51702440 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C58 |
Chr8:51702449 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B104,B140,D11 |
Chr8:51702455 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 12 | A25,A5,B113,B123,B20,B25,B48,B51,B85,C31,C56,C68 |
Chr8:51702461 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B113,B7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。