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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004231`

染色体: Chr08 坐标: 51723173-51724111 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004231`
名称	SmilChr08G004231
描述	F-box protein At5g07610-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51723173 - 51724111 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998643`
GeneID	`130998643`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998643`
原始查询	`LOC130998643`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g07610-like
产物	F-box protein At5g07610-like
Arabidopsis	`AT4G17780` (AT4G17780) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827499] identity=26.13; qcov=0.833; evalue=4.05e-10; confidence=low
Rice	`Os11g0131300` (OsFbox565) - identity=21.3; qcov=0.952; evalue=6.72e-09; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998643

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780041.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057780041.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780041.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057780041.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51723190`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C80
`Chr8:51723190`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C80
`Chr8:51723304`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B122,B24,B76,C2,C41,D6
`Chr8:51723359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,D8
`Chr8:51723409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B48,B52,C10,C6
`Chr8:51723523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:51723614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr8:51723636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B58
`Chr8:51723676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,D8
`Chr8:51723725`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A3,B4,B71,B98,B99,C22,C36,C73,D10
`Chr8:51723891`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	93	A1,A20,A25,B101,B103,B104,B106,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B125,B128,B129,B131,B132,B14,B15,B22,B27,B33,B34,B35,B37,B40,B41,B48,B49,B50,B51,B52,B54,B57,B60,B61,B67,B69,B71,B73,B77,B81,B82,B89,B91,B93,B95,C1,C10,C11,C13,C17,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C29,C3,C31,C32,C35,C36,C38,C4,C43,C49,C50,C57,C6,C64,C66,C68,C69,C70,C74,C75,C78,C80,C81,C82,C85,D1,D11,D2,D5
`Chr8:51723905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B115,B37,C38,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780041.1

312 aa

156

312

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 77-268 aa PF07734 FBA_1 81-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780041.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	77	268	1.4e-09	38.1	F-box associated beta propeller domain
`XP_057780041.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	81	254	3.6e-15	56.5	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924058.1
ATGAACATCCTCTCCAGACTCCCCATTCGAAGCATCATCAAGTCGAAGCTTGTGCGCAGGGCATTCCGCGACATGCTCGACTCTCGTGATTTCCGTCTTCCTAAATCCAACCCACGCCTCATTCTGTCTCGATTCCCAAGGTCCACATTCTACCGAATCTGCGAAATCAACGGCAGAGACGCCGCCCCCGAGCTGGTGGTCGAGCTCCCCATTCCCGGCACGGAGGCCGCACATGCCTCAGTCGACGGCTTGATCTTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057780041.1_45436
ATGAACATCCTCTCCAGACTCCCCATTCGAAGCATCATCAAGTCGAAGCTTGTGCGCAGGGCATTCCGCGACATGCTCGACTCTCGTGATTTCCGTCTTCCTAAATCCAACCCACGCCTCATTCTGTCTCGATTCCCAAGGTCCACATTCTACCGAATCTGCGAAATCAACGGCAGAGACGCCGCCCCCGAGCTGGTGGTCGAGCTCCCCATTCCCGGCACGGAGGCCGCACATGCCTCAGTCGACGGCTTGATCTTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780041.1
MNILSRLPIRSIIKSKLVRRAFRDMLDSRDFRLPKSNPRLILSRFPRSTFYRICEINGRDAAPELVVELPIPGTEAAHASVDGLIFIVCKVLPRFIIRNPITREFFKLSAPFGQSYSYDAEKYKFGFGVSGASRRYKVVRICGSECLVYTLGSGRWRAVGVGAVAPPLLRSRCDWFSEPAFLGGNLHWLDSETNVICFDLETEVLTYFSAPPHQHRSKDDRCFRRVSALDDCLCLTELHCGALDDVEIDIWFMRNGRDWS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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