当前解析结果
SmilChr08G004261| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004261 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004261 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G004261 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 52094082 - 52094585 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998649 |
|---|---|
| GeneID | 130998649 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998649 |
| 原始查询 | LOC130998649 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998649 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057780047.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780047.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780047.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057780047.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057780047.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:52094091 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D2 |
Chr8:52094100 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,A21,B50,C43 |
Chr8:52094112 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,B38,B66,B79 |
Chr8:52094122 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D2 |
Chr8:52094144 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A23,B59,C59 |
Chr8:52094172 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B136 |
Chr8:52094172 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B136 |
Chr8:52094186 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C42 |
Chr8:52094236 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A14,B113,B50,C43,C86 |
Chr8:52094246 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr8:52094250 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 15 | A1,A6,B113,B29,B5,B57,B69,B74,B83,B95,C19,C32,C68,C7,C79 |
Chr8:52094274 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 30 | B105,B106,B107,B110,B127,B2,B23,B27,B42,B43,B5,B56,B7,B74,B76,B86,B96,C13,C16,C20,C28,C35,C48,C52,C69,C74,C8,D11,D2,D3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。