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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004289`

染色体: Chr08 坐标: 52565892-52567247 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004289`
名称	SmilChr08G004289
描述	uncharacterized SmilChr08G004289
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	52565892 - 52567247 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998658`
GeneID	`130998658`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998658`
原始查询	`LOC130998658`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=44.6; qcov=0.664; evalue=9.31e-72; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=44.9; qcov=0.919; evalue=9.72e-107; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998658

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780056.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057780056.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057780056.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780056.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780056.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:52565897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr8:52565899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr8:52565916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B104,B125,B13,C82
`Chr8:52565917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:52565930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B34,C20
`Chr8:52565941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C17,C3,C51,C71
`Chr8:52565944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	54	A10,A15,A2,A24,A8,B10,B103,B104,B109,B118,B122,B124,B136,B139,B23,B25,B28,B30,B44,B6,B7,B73,B74,B76,B80,B82,B85,B90,B91,B92,B95,C11,C15,C17,C18,C2,C20,C24,C3,C30,C32,C48,C51,C52,C61,C62,C64,C66,C67,C68,C69,C71,C81,C87
`Chr8:52565945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	64	A10,A14,A15,A2,A24,A5,A8,B102,B103,B104,B105,B109,B118,B122,B124,B128,B139,B23,B25,B28,B30,B37,B43,B44,B46,B56,B6,B60,B62,B67,B7,B73,B74,B76,B77,B80,B82,B85,B90,B91,B92,B95,B96,C11,C15,C18,C2,C20,C24,C3,C30,C32,C48,C52,C61,C62,C64,C66,C67,C68,C69,C71,C81,C87
`Chr8:52565949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	52	A10,A15,A2,A24,A8,B10,B103,B104,B109,B118,B122,B124,B136,B139,B23,B25,B28,B30,B44,B6,B7,B73,B74,B76,B80,B82,B85,B90,B91,B92,B95,C11,C15,C18,C2,C20,C24,C3,C30,C32,C48,C52,C61,C62,C64,C66,C67,C68,C69,C71,C81,C87
`Chr8:52565986`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B109,B111,B135,B38,B39,B42,B43,B59,B66,B68,B89,C27,C29,C55
`Chr8:52565993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr8:52565994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780056.1

405 aa

202

405

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 66-104 aa PF04827 Plant_tran 174-206 aa PF04827 Plant_tran 207-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780056.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	66	104	1.4e-16	60.6	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057780056.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	174	206	3e-70	236.7	Plant transposon protein
`XP_057780056.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	207	329	3e-70	236.7	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924073.1
ATGGCCTCTAGTTCTAATATTGATGCTTCAAATTCTAGCGATGATGAAGCATGGGAACAAAGCGTTGCCGAACATAATCGCCAACTTGATCGCATCATTGAGGATGTGGTCATCCATGCCGCAAGTCTATCTGTACAACCTACCAATCATGCCGTTAGAGGAAGGAGACGGTATATTGAAAGAAGACGTGAGATAGGCCATGAAGGTGTGTTCGAGCAGTACTTTTCAGAAGATCCAATCTATCCCCCAGAATATTTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998658
ATGGCCTCTAGTTCTAATATTGATGCTTCAAATTCTAGCGATGATGAAGCATGGGAACAAAGCGTTGCCGAACATAATCGCCAACTTGATCGCATCATTGAGGATGTGGTCATCCATGCCGCAAGTCTATCTGTACAACCTACCAATCATGCCGTTAGAGGAAGGAGACGGTATATTGAAAGAAGACGTGAGATAGGCCATGAAGGTGTGTTCGAGCAGTACTTTTCAGAAGATCCAATCTATCCCCCAGAATATTTTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780056.1
MASSSNIDASNSSDDEAWEQSVAEHNRQLDRIIEDVVIHAASLSVQPTNHAVRGRRRYIERRREIGHEGVFEQYFSEDPIYPPEYFRTRFRMRKPLFERIMNKLVATDRFFQQHPDAAGRLGMSPIQKCTAAMRVLAYGTSADLHDEYLRMSAQVIRKSVIKFVEGVISNFGAEYLRKPTEEDMAALLHIGERRGFPGMMGSIDCLRNDINVLDQSPVFDDILEGRAPKVNYIVNGHERNMGYYLTDGIYPQWAAFIKSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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