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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004340`

染色体: Chr08 坐标: 53072357-53073966 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004340`
名称	SmilChr08G004340
描述	gibberellin 20-oxidase-like protein
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53072357 - 53073966 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998667`
GeneID	`130998667`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998667`
原始查询	`LOC130998667`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	gibberellin 20-oxidase-like protein
产物	gibberellin 20-oxidase-like protein
Arabidopsis	`AT5G51310` (AT5G51310) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835205] identity=55.8; qcov=0.882; evalue=1.66e-129; confidence=high
Rice	`Os03g0856700` (GA20OX1) - identity=32.6; qcov=0.858; evalue=3.71e-38; confidence=low
GO	GO:0051213 (dioxygenase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998667

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780064.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057780064.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057780064.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780064.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780064.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53072453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr8:53072472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B20,B84,D1
`Chr8:53072487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C46,C86
`Chr8:53072506`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B107,B80,B91
`Chr8:53072506`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B107,B80,B91
`Chr8:53072582`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B105,B20,B84,C26,D1
`Chr8:53072582`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B105,B20,B84,C26,D1
`Chr8:53072708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr8:53072824`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A6,B50,D3
`Chr8:53072824`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A6,B50,D3
`Chr8:53072934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B99,C87
`Chr8:53073833`	`CT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780064.1

372 aa

186

372

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 52-125 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 206-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780064.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	52	125	2.3e-17	64.5	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057780064.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	206	313	1.9e-23	83.4	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924081.1
TAAAAAGTCAAGTGATTGCGACCTCATATTAGATGTGTATATCTATTCCTTTGAACAATAATCATTTGTTACATAACTCTTACATTTATTTTCACATTATCATTAACCACCACCCTACTTTAAAAAGAAAAAAGGAAAAAAGAAATTCTTCCAAGATGATCTATGAATCAGAGAGCCCCTTAGAGCTCCCAGTTGTCGACGTTTCTGAGGCGTTGGATTCATCATCACTGAGCTCCCTAGGCGCCGCCTGCCGAGAATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998667
ATGTGTATATCTATTCCTTTGAACAATAATCATTTGTTACATAACTCTTACATTTATTTTCACATTATCATTAACCACCACCCTACTTTAAAAAGAAAAAAGGAAAAAAGAAATTCTTCCAAGATGATCTATGAATCAGAGAGCCCCTTAGAGCTCCCAGTTGTCGACGTTTCTGAGGCGTTGGATTCATCATCACTGAGCTCCCTAGGCGCCGCCTGCCGAGAATGGGGTTTCTTCCAGATCATCAACCATGGAATCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780064.1
MCISIPLNNNHLLHNSYIYFHIIINHHPTLKRKKEKRNSSKMIYESESPLELPVVDVSEALDSSSLSSLGAACREWGFFQIINHGISKDLYAKIYSLSTNIFSLPSQSKLKLGPSSHLKTYTPHFIASPFFESLRVSGPDFAASAQSSASVLAHHDNQFSEMMHEYGSKMSELSKTILRLILKTLGSEIESKYYESEFHQCHGYMRINNYASPEGSCIEPSGSGEEEGLGMHTDMSCVTIVYQDEIGGLQVRSREGRWMS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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