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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004370`

染色体: Chr08 坐标: 53442765-53443733 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004370`
名称	SmilChr08G004370
描述	uncharacterized SmilChr08G004370
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53442765 - 53443733 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998671`
GeneID	`130998671`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998671`
原始查询	`LOC130998671`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0590366` - identity=28.5; qcov=0.718; evalue=1.98e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998671

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780067.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057780067.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780067.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780067.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780067.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53443076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B87
`Chr8:53443104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B8,B98,C53,C61
`Chr8:53443160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B77,C19,C47
`Chr8:53443164`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A10,B11,B49,B58,B74,B8,B98,C61,C72
`Chr8:53443167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:53443176`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A10,B11,B49,B58,B61,B74,B98,C61,C72
`Chr8:53443252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A10,B11,B16,B49,C3,C61,C72,C86
`Chr8:53443254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B2
`Chr8:53443279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B60
`Chr8:53443279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr8:53443285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B19,B25,B34
`Chr8:53443317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B131,B133,B15,C15

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924084.1
TGCGTAAAGTTTTCATTTTGGGTAAACATCGATTGGAAACATGCATTTGGACCTCTCTTTTCGTTTATCTTCGGCTTTCATACTTTGCGGTTTCGATATATTTTAATTTTCGGTCCTACTCTAATTTATTATTGCTATTGTCCTCATATTTTAGATTGTTATGGATTCTGCTAGGTTTTCGTGATGTTTGACGCAAGCTTATTCATTCCTGTTTACTACTGCAATTGCATCCCTCAGTTGCAAAGTGTATATATATAGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998671
ATGTATAGTTATTTGAGTGCCTATTTGTTTCAAATCCCTAATCATGTGCTTGGTGTCTTGCTTGTGTATGCTCGCACGGCCTCTGCGAGTAATGAATTGGGACGTGCGAAGTCCAAAAAATGCGAAAAGACAAGACGTAGTTGGTCAGTAAGGGAAGAAGAGGTTCTTATTGCTGCGTTGAAGGAGCTCGTTGTGCAGGGCTGGCAGTCGGACAATGGTTTCCGAGTTGGTTACCTAGGAAAGCTTGAGGAAGCCGTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780067.1
MYSYLSAYLFQIPNHVLGVLLVYARTASASNELGRAKSKKCEKTRRSWSVREEEVLIAALKELVVQGWQSDNGFRVGYLGKLEEAVKSAFPGTDLKGIPHIHSKRSTWKKNYGSLTTILGKSGTDFNVDGKFMIDCDAELWELIVNNDPNARNMRKKSWNYLEDWKEIFGKRRMLRTQYTK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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