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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004381`

染色体: Chr08 坐标: 53556549-53557953 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004381`
名称	SmilChr08G004381
描述	uncharacterized SmilChr08G004381
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53556549 - 53557953 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998673`
GeneID	`130998673`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998673`
原始查询	`LOC130998673`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=36.6; qcov=0.495; evalue=4.13e-47; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998673

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780070.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057780070.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780070.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780070.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780070.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53556566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B62,B81,C41
`Chr8:53556584`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	A1,B1,B101,B108,B117,B12,B120,B121,B124,B18,B37,B4,B41,B48,B51,B55,B57,B60,B73,B74,B76,B79,B8,C18,C20,C36,C50,C58,C62,C75
`Chr8:53556609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr8:53556613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,C19,D10
`Chr8:53556657`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B59
`Chr8:53556657`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B59
`Chr8:53556672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	A16,A18,A5,A6,B100,B108,B11,B111,B125,B135,B17,B34,B41,B45,B5,B65,B74,B77,B90,B92,C19,C2,C39,C4,C40,C46,C54,C70,C8,C83,C84
`Chr8:53556726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C43
`Chr8:53556855`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A1,A24,A7,B107,B135,B17,B20,B25,B33,B34,B41,B51,B52,B61,B67,B83,C26,C31,C46,C60,C83,C86,D4
`Chr8:53556877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr8:53556896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,C19,C47
`Chr8:53556990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B97,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780070.1

436 aa

218

436

DUF7769

PF24964 DUF7769 4-45 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780070.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	4	45	2.3e-07	31.1	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924087.1
ATGGGTCATTGGCTTCTCGCAAATAGCACCAACGGGAAACCGAACGATGGAGCACAAAAGGAGGCAGCTGCTAGGTTTGGTGTGTCGAGGCGAACGGTGCGTCGTTTCTGGAGCAAAACAAAACAGAAAATTCAGTCAGGTGCAGCAGTGATATTCACATCAGCTCACAAAGGTACAGTTCACAAAGATAGGAAAAAACTTGATGTTGAGAAGGTTAAGTCATTGTCCATTCTTGAGAGGTCTACAATTCGTAAAATGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998673
ATGGGTCATTGGCTTCTCGCAAATAGCACCAACGGGAAACCGAACGATGGAGCACAAAAGGAGGCAGCTGCTAGGTTTGGTGTGTCGAGGCGAACGGTGCGTCGTTTCTGGAGCAAAACAAAACAGAAAATTCAGTCAGGTGCAGCAGTGATATTCACATCAGCTCACAAAGGTACAGTTCACAAAGATAGGAAAAAACTTGATGTTGAGAAGGTTAAGTCATTGTCCATTCTTGAGAGGTCTACAATTCGTAAAATGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780070.1
MGHWLLANSTNGKPNDGAQKEAAARFGVSRRTVRRFWSKTKQKIQSGAAVIFTSAHKGTVHKDRKKLDVEKVKSLSILERSTIRKMAVKLGVSKSLLGQLIKRKELRPHTSAIKPQLTDVNKIARMKFCLSNVVYDGAMSRYSYQSMHNVVHIDEKWFYMTKTSDRYYLLPEETDPYRACKSKRFITKVMFMCAVTRPQFSADGQELFDGKIGIFPFTTLEATKRKSKNRAKGVLEVKPIQSITKDVIKECIIKQVIPAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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