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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004417`

染色体: Chr08 坐标: 53856723-53857579 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004417`
名称	SmilChr08G004417
描述	uncharacterized SmilChr08G004417
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53856723 - 53857579 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998679`
GeneID	`130998679`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998679`
原始查询	`LOC130998679`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=38.4; qcov=0.337; evalue=3.01e-11; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF08284 (RVP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998679

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780075.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057780075.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057780075.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057780075.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780075.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53857069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr8:53857124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B122,D2
`Chr8:53857124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D2
`Chr8:53857185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C58
`Chr8:53857207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr8:53857220`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr8:53857220`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr8:53857239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C58
`Chr8:53857322`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C9
`Chr8:53857322`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C9
`Chr8:53857484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B96,C42
`Chr8:53857503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780075.1

255 aa

128

255

RVP_2

PF08284 RVP_2 199-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780075.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	199	254	3.1e-13	50.4	Retroviral aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924092.1
ATGAATAAATACTTTCCCCTCTCATTCAGAGAAAAGAAGGAGACCGAGTTCTTTGAGTTGAAACAAGGGAATATGACTATAGAGGAGTATGAAAGGAAATTCAATGAGTTGGCCCGTTTTGCTCCACACCTAGTTGATACAGAAGATAAGATGATCGCTAGGTTCAGAAAAGGGTTAAGAATTGACATCAAAGGAATTATGGCTGCACATGTGATTGACGATTTCAGCGACCTGGTTAAGCGAGCGGAAGAAGTGGGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998679
ATGAATAAATACTTTCCCCTCTCATTCAGAGAAAAGAAGGAGACCGAGTTCTTTGAGTTGAAACAAGGGAATATGACTATAGAGGAGTATGAAAGGAAATTCAATGAGTTGGCCCGTTTTGCTCCACACCTAGTTGATACAGAAGATAAGATGATCGCTAGGTTCAGAAAAGGGTTAAGAATTGACATCAAAGGAATTATGGCTGCACATGTGATTGACGATTTCAGCGACCTGGTTAAGCGAGCGGAAGAAGTGGGCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780075.1
MNKYFPLSFREKKETEFFELKQGNMTIEEYERKFNELARFAPHLVDTEDKMIARFRKGLRIDIKGIMAAHVIDDFSDLVKRAEEVGTALGTNHPTSKSTNQPMKRKWENPNQSGGNFQDKRSKFGSNTSANTQVTKPQCQKCGKFHNGECLWGKGVCFFCHEPGHTVSTCPKNKRNVPEGRMNVGLNKGSGKEPERKGNARFFSLTQQEEVEDGNTMTGTLIISGTPAVVLFDSGASHSFISPKFCQKNKIIWEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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