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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004515`

染色体: Chr08 坐标: 54769715-54770866 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004515`
名称	SmilChr08G004515
描述	uncharacterized SmilChr08G004515
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54769715 - 54770866 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998695`
GeneID	`130998695`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998695`
原始查询	`LOC130998695`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836619]; symbol=AT5G64950; hit=AT5G64950; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836619]; symbol=AT5G64950; hit=AT5G64950; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G64950` (AT5G64950) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836619] identity=27.51; qcov=0.893; evalue=1.72e-37; confidence=low
Rice	`Os07g0423000` - identity=26.78; qcov=0.762; evalue=8.82e-30; confidence=low
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998695

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057780089.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54769873`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B40
`Chr8:54769873`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B40
`Chr8:54769885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10
`Chr8:54769885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:54769892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B62,B64
`Chr8:54770007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:54770122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,B55,B88,D6
`Chr8:54770123`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr8:54770123`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr8:54770133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C36,D6
`Chr8:54770204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr8:54770214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C12,C40,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780089.1

383 aa

192

383

mTERF

PF02536 mTERF 43-204 aa PF02536 mTERF 250-353 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780089.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	43	204	1.6e-28	100.3	mTERF
`XP_057780089.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	250	353	1.6e-28	100.3	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924106.1
ATGATTGCAGTTGCACGCAGGAATCTCTCCTGTTTATTTGTAAACCCTAATTCATTTCTCTGCAACTCCAATGCTCATCTCTTCCCGTCAATCCATTTCTTCTCCACTTGGAGGGTGAAAAACCTAATCCCTAACCCTAAAATCTACGATCTATTGGTCAACAAACACCAATTTCCTCCTGATTTAGCTTCACTAGCTTCATCGTGTTTACCTAAAGCTAGTAGCCCCATAGGAGCTGATTCAGTAGTGTCATTCCTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057780089.1_45785
ATGATTGCAGTTGCACGCAGGAATCTCTCCTGTTTATTTGTAAACCCTAATTCATTTCTCTGCAACTCCAATGCTCATCTCTTCCCGTCAATCCATTTCTTCTCCACTTGGAGGGTGAAAAACCTAATCCCTAACCCTAAAATCTACGATCTATTGGTCAACAAACACCAATTTCCTCCTGATTTAGCTTCACTAGCTTCATCGTGTTTACCTAAAGCTAGTAGCCCCATAGGAGCTGATTCAGTAGTGTCATTCCTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780089.1
MIAVARRNLSCLFVNPNSFLCNSNAHLFPSIHFFSTWRVKNLIPNPKIYDLLVNKHQFPPDLASLASSCLPKASSPIGADSVVSFLKENSFTATQLQKVVTYDSRILGFTIESINFKFKVFQNLGLSPKEIAKIIFENTTILHSSYENRIIPKLSMLKCLLGSDHDVARLLIRCSWFLLADLEKTLMPNIEILKSYSIPMERILYFLHLRPRCFVVKPDIMQKSVVRAIEFGVPWTSGVFIQAVSLFTHTSKGMWEVKVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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