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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004521`

染色体: Chr08 坐标: 54794773-54795410 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004521`
名称	SmilChr08G004521
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 8-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54794773 - 54795410 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998698`
GeneID	`130998698`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998698`
原始查询	`LOC130998698`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 8-like
产物	transcription initiation factor TFIID subunit 8-like
Arabidopsis	`AT1G31240` (AT1G31240) Bromodomain transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840012] identity=41; qcov=0.832; evalue=5.18e-22; confidence=medium
Rice	`Os02g0699900` - identity=36; qcov=0.803; evalue=1.53e-18; confidence=low
GO	GO:0005669 (transcription factor TFIID complex); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	smil03022 (Basal transcription factors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07524 (Bromo_TP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998698

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780092.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780092.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780092.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780092.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780092.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54794787`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B72
`Chr8:54794787`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B72
`Chr8:54794816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:54794821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C54
`Chr8:54794830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B135
`Chr8:54794834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B22,B32,C33,C40
`Chr8:54794847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr8:54794858`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C68
`Chr8:54794858`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C68
`Chr8:54794915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C27
`Chr8:54794916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B51
`Chr8:54794931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B138,B51,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780092.1

173 aa

173

Bromo_TP

PF07524 Bromo_TP 7-69 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780092.1`	Pfam	`PF07524`	Bromo_TP	Domain	7	69	6.6e-16	58.8	Bromodomain associated

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924109.1
AACTTGTTTTTTTTTCTGGTGGCGGTAGCACAAATCTGTCAATCGATAGGCTACAAAGGAGCTGAGAGACCGGCGCTCGAATACCTAACCAACATCGCTACCAGATATTTGAAAGCAGTAGCCAAATTGAGCGTGGAATCCGCCAATTCGAGCGGGCGCACCGAATCAAACCTCTTCGACATCGTCGCCGTGATCGAAGACTTGACATCGGTGCAAGGCTTCGACGGCGCGTGGAGAGTGAGGTCGCAATCGTTGTGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998698
AACTTGTTTTTTTTTCTGGTGGCGGTAGCACAAATCTGTCAATCGATAGGCTACAAAGGAGCTGAGAGACCGGCGCTCGAATACCTAACCAACATCGCTACCAGATATTTGAAAGCAGTAGCCAAATTGAGCGTGGAATCCGCCAATTCGAGCGGGCGCACCGAATCAAACCTCTTCGACATCGTCGCCGTGATCGAAGACTTGACATCGGTGCAAGGCTTCGACGGCGCGTGGAGAGTGAGGTCGCAATCGTTGTGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780092.1
NLFFFLVAVAQICQSIGYKGAERPALEYLTNIATRYLKAVAKLSVESANSSGRTESNLFDIVAVIEDLTSVQGFDGAWRVRSQSLWRSAVIRDLMKLVKYTDQTPFAQPLLPRRSCSDKEILLKDRDNNGWYNEGRLKHVPRWLPAVVERGGGAEEREGEVKWEESMEREGFC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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