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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004531`

染色体: Chr08 坐标: 54875982-54878235 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004531`
名称	SmilChr08G004531
描述	uncharacterized SmilChr08G004531
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54875982 - 54878235 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998703`
GeneID	`130998703`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998703`
原始查询	`LOC130998703`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=34.9; qcov=0.475; evalue=7.19e-27; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998703

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057780098.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780098.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057780098.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057780098.1`
5	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057780098.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54876015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B31,B33,C5
`Chr8:54876016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C7
`Chr8:54876055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B65
`Chr8:54876061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B58,B89,C10,C45
`Chr8:54876066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A6,B120,B40,B82,D5
`Chr8:54876066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B120,B40,B82,D5
`Chr8:54876094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B75
`Chr8:54876113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,C46,C82
`Chr8:54876117`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B93,C60
`Chr8:54876117`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B93,C60
`Chr8:54876120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,D9
`Chr8:54876154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780098.1

362 aa

181

362

PEG10_N-capsid

Ty3_capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 71-151 aa PF19259 Ty3_capsid 77-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780098.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	71	151	2.5e-08	34.9	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
`XP_057780098.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	77	230	1.4e-08	35.1	Ty3 transposon capsid-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924115.1
ATGGCCAGGACAAGGGGTAATAGGAGACCTCCGGCAGATGAAGAATCTGATAGCGAAGCCACTCAATCAATGGGAAATAGGAATCAAAATCGAAACGATGTTAATACACTGGCCCAAGTACTAGTACAGGCGTTGAGGGGGGCATTGCCTCAACAACCACCACAACCTCAGGCGGAAAGTGGAAATGGAGTAGTAGCTCAGTTCCGGAGCATGGCACCACCGACGTTGAAAGGAAACGAGGGACCTTTGGGGACTGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998703
ATGGCCAGGACAAGGGGTAATAGGAGACCTCCGGCAGATGAAGAATCTGATAGCGAAGCCACTCAATCAATGGGAAATAGGAATCAAAATCGAAACGATGTTAATACACTGGCCCAAGTACTAGTACAGGCGTTGAGGGGGGCATTGCCTCAACAACCACCACAACCTCAGGCGGAAAGTGGAAATGGAGTAGTAGCTCAGTTCCGGAGCATGGCACCACCGACGTTGAAAGGAAACGAGGGACCTTTGGGGACTGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780098.1
MARTRGNRRPPADEESDSEATQSMGNRNQNRNDVNTLAQVLVQALRGALPQQPPQPQAESGNGVVAQFRSMAPPTLKGNEGPLGTEEWMRQMERIFNYMRSRDDSKVTCAAFQLIDDAGHWWESETAVFTEEQVRAISWRTFKEKVMEKYFPKAFRKQKEIELMNLEQGNLTVLEYERKFTQLARFAPHLVDTDEKKAWRFENGLRPEIGGHLAALNITSYSEILERAQAVASRLKLDNSVARPQHTGGKRQWDDRDKKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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