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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004584`

染色体: Chr08 坐标: 55416239-55419004 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004584`
名称	SmilChr08G004584
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55416239 - 55419004 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998727`
GeneID	`130998727`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998727`
原始查询	`LOC130998727`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=25.6; qcov=1.16; evalue=4.59e-43; confidence=low
Rice	`Os11g0229500` (RPR1*) - identity=33.2; qcov=0.778; evalue=9.22e-52; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998727

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057780119.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057780119.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057780119.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780119.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780119.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55417452`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A11,A18,A23,A6,A8,B104,B111,B112,B115,B120,B121,B137,B14,B24,B3,B32,B41,B46,B57,B68,B91,C19,C33,C38,C45,C7,C78,C79,C82,D6,D8
`Chr8:55417456`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A14,A25,C29,C80,C84
`Chr8:55417456`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A14,A25,C29,C80,C84
`Chr8:55417540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr8:55417598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr8:55417616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr8:55417633`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B47
`Chr8:55417633`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B47
`Chr8:55417848`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B104,B87,C81
`Chr8:55417848`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B104,B87,C81
`Chr8:55417870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:55417873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780119.1

558 aa

279

558

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 3-93 aa PF23559 WHD_DRP 177-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780119.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	3	93	3.8e-21	76.1	NB-ARC domain
`XP_057780119.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	177	247	9.2e-16	58.4	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924136.1
GTGATTGAATCGTGGATCGAATTCATTCTGTATCCAATCAAGCAAGCCTTGGATGCACGGTCGATCTGCAGCAGATCGATGGCTGCAGCTCTAGTTTCTCTGATGAATACGGTGGAGCAGATCCAAAACCACCCTCAACTTTCCACTTCTCTTCATCATTTCCAGATTGAGATCCTCCGCGAAAAAGTTTATTTCTTCCTAGATTTTATAGAAAGTTATTCCTCTCATGTAGATGATTTGGAGAGGCGGATTGCAACTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998727
ATGGACAATGAAAGAGACGAGTATCGATTAGGAGAACAATTGTATAAAGGTTTGACGGGTAGAAGGTATCTGATTGTACTAGATGACGTGTGGAGTGTTGAAGTTTGGGATAAGATAAGGTTTTATTTTCCTGATAATGGGAATAGAAGTCGCCTCATTTTCACTACTAGGCTTTCAGATGTGGCTTTCTATTGTGGATCGTGTTGTGTTAGGGTGAATCTTTTAGATGAGTGTGAATGTTGGGACCTATTTTGCGTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780119.1
MDNERDEYRLGEQLYKGLTGRRYLIVLDDVWSVEVWDKIRFYFPDNGNRSRLIFTTRLSDVAFYCGSCCVRVNLLDECECWDLFCVRVFGEEDCPLELEQIGREIAKMCKGLPLSITVIGGLLQKSAKTVEYWHNVLENIRVILSSGEGDQCLNVLYSSYSHLPAHLKPCFLYMGTFQEDREIPVSRITKLWAAEGFLKPKAARVLEEVAEDYLKDLIDRNLVLVGKYRKNGKVRSVYIHDLLRDLCISLADREKLFSSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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