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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004611`

染色体: Chr08 坐标: 55661254-55662240 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004611`
名称	SmilChr08G004611
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55661254 - 55662240 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998739`
GeneID	`130998739`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998739`
原始查询	`LOC130998739`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=37.3; qcov=0.589; evalue=2.65e-32; confidence=medium
Rice	`Os11g0229400` - identity=40.7; qcov=0.599; evalue=7.82e-36; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998739

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780131.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780131.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780131.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780131.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780131.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55661419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B7,C20,C53
`Chr8:55661425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr8:55661440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B25,C53
`Chr8:55661539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr8:55661608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr8:55661659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C56
`Chr8:55661673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B39,C54
`Chr8:55662014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,B74
`Chr8:55662020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B136,B138
`Chr8:55662024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B5,B74
`Chr8:55662089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C41
`Chr8:55662097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780131.1

287 aa

144

287

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 24-103 aa PF23559 WHD_DRP 191-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780131.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	24	103	1.1e-15	58.4	NB-ARC domain
`XP_057780131.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	191	262	1.6e-21	76.8	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924148.1
ATGGATGTTGTGGAGGAGAAACAACCTCTCACCACCACCACCGGAAAGGCTTCTCCGGTGGGACTCAAAGACGACGTGATCCACATCATGGACAAGCTCACCATACATCAACCCAAGCAGCAAATCATCTCGGTTGTTGGGATGGGCGGCACAGGTAAGACCACGCTTGCTCTAAATGTTTATGAAAACCCATTCGTCAAGGAACACTTTCACATTCGTGCTTGGGCTATTGTATCTAAACAATACAGTGCAAAAGAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998739
ATGGATGTTGTGGAGGAGAAACAACCTCTCACCACCACCACCGGAAAGGCTTCTCCGGTGGGACTCAAAGACGACGTGATCCACATCATGGACAAGCTCACCATACATCAACCCAAGCAGCAAATCATCTCGGTTGTTGGGATGGGCGGCACAGGTAAGACCACGCTTGCTCTAAATGTTTATGAAAACCCATTCGTCAAGGAACACTTTCACATTCGTGCTTGGGCTATTGTATCTAAACAATACAGTGCAAAAGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780131.1
MDVVEEKQPLTTTTGKASPVGLKDDVIHIMDKLTIHQPKQQIISVVGMGGTGKTTLALNVYENPFVKEHFHIRAWAIVSKQYSAKEIFSKLLSSIGQSGSETDLGLKLHQSLWESVGNEIIRLCRGLPLSIVVIGGFLLKSPKTVGFWEDVAKNIKSIPNSTEKQEILDVLFLSYSHLPPHLKPCFLYMGIFREDREIRASRIIKLWVAEGFIKPKRAQMLEEIAEGYLNDLVDRNLVLVGRHRSNGKIRSCRLHDLIRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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