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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004613`

染色体: Chr08 坐标: 55679317-55681932 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004613`
名称	SmilChr08G004613
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55679317 - 55681932 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998740`
GeneID	`130998740`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998740`
原始查询	`LOC130998740`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=33.8; qcov=0.553; evalue=7.68e-65; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=35.9; qcov=0.406; evalue=2.6e-69; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998740

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057780132.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780132.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780132.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780132.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780132.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55679329`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A16,A21,A24,A5,B1,B105,B123,B135,B14,B25,B47,B5,B8,C44,C69
`Chr8:55679358`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C40
`Chr8:55679358`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C40
`Chr8:55679359`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B60,C40,C45,C82
`Chr8:55679359`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B60,C40,C45,C82
`Chr8:55679429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr8:55679431`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B10,B109,B36,B41,B51,B88,C3,C42,C63,C77,C80
`Chr8:55679471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B36,C32,C74,D6
`Chr8:55679581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B107,B110,B70,C53
`Chr8:55679599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr8:55679770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C40
`Chr8:55679794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780132.1

871 aa

436

871

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 154-319 aa PF23559 WHD_DRP 400-471 aa PF23598 LRR_14 534-817 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780132.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	154	319	3.1e-42	144.8	NB-ARC domain
`XP_057780132.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	400	471	2.2e-21	76.4	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057780132.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	534	817	3.1e-14	53.2	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924149.1
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTGTGATGAACATTATTGAGCAGATGATGAGCCATCCTCGCGTTTCAACTGTATTCGACAAGAAACAGATTGAATCCATTGGGGAAAAGGCTGATGGCTTGCTCGACTTGATTACCAACAGTAATATTGATGGAGGTAGCAAAGAAGCATCAGATCTGGAGAGTCAAATCGCATCTGCAGCTCACGCAGCTGAAGATGTGATTGAATCACACATTGTCGATCAAATTCAAGCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998740
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTGTGATGAACATTATTGAGCAGATGATGAGCCATCCTCGCGTTTCAACTGTATTCGACAAGAAACAGATTGAATCCATTGGGGAAAAGGCTGATGGCTTGCTCGACTTGATTACCAACAGTAATATTGATGGAGGTAGCAAAGAAGCATCAGATCTGGAGAGTCAAATCGCATCTGCAGCTCACGCAGCTGAAGATGTGATTGAATCACACATTGTCGATCAAATTCAAGCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780132.1
MAAYAALVSVMNIIEQMMSHPRVSTVFDKKQIESIGEKADGLLDLITNSNIDGGSKEASDLESQIASAAHAAEDVIESHIVDQIQAGSSQPSHGCSVLDLQQIIEEMDGIMIKGAELKEKWRAREEQATHGDVDVVEEQQPLTTTRKASPVGLEDDVMHIMHKLTTHQPEQHVISIVGMGGTGKTTLALNVYENSLIKGHFDIRAWATVSQQYSAQEIFSKLLSSIGQSGSGNDLGLKLHQTLSGRRYLIVLDDIWSIEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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