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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004615`

染色体: Chr08 坐标: 55706889-55707881 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004615`
名称	SmilChr08G004615
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55706889 - 55707881 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998741`
GeneID	`130998741`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998741`
原始查询	`LOC130998741`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine-rich RECEPTOR-like kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828415]; symbol=CRK8; hit=AT4G23160; species=arabidopsis; confidence=high
产物	cysteine-rich RECEPTOR-like kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828415]; symbol=CRK8; hit=AT4G23160; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G23160` (CRK8) cysteine-rich RECEPTOR-like kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828415] identity=52.9; qcov=0.842; evalue=1.15e-96; confidence=high
Rice	`gene-orf490` (orf490) - identity=46.9; qcov=0.918; evalue=8.9e-88; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07727 (RVT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998741

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780133.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057780133.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780133.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780133.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780133.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55706903`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B110
`Chr8:55706903`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B110
`Chr8:55706909`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B110
`Chr8:55706909`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B110
`Chr8:55706958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,D1
`Chr8:55706968`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	28	B105,B108,B125,B130,B134,B15,B3,B31,B36,B49,B56,B58,B66,B74,B77,B81,B84,B96,C14,C3,C37,C38,C4,C47,C56,C64,C73,C80
`Chr8:55706977`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	36	A20,B1,B101,B110,B111,B12,B138,B139,B14,B26,B28,B29,B33,B35,B42,B50,B62,B67,B74,B78,B88,B9,B99,C12,C15,C23,C24,C28,C31,C40,C41,C72,C74,C79,C82,C83
`Chr8:55706980`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	37	A20,B1,B101,B110,B111,B12,B138,B139,B14,B26,B28,B29,B33,B35,B42,B50,B62,B67,B74,B88,B9,B99,C12,C15,C23,C24,C27,C28,C31,C40,C41,C72,C74,C79,C80,C82,C83
`Chr8:55707051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B53
`Chr8:55707055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:55707059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B133,B18,B45,B91
`Chr8:55707062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B40,B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780133.1

330 aa

165

330

RVT_2

PF07727 RVT_2 10-89 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780133.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	10	89	5.1e-18	66.3	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924150.1
ATGCAAGATAAAGGCAAGTTTCTTGGATTGGTTGTTTATGTTGATGATATATTGCTTGCTAGCAATGATGACAATTTGGTGGATTCTTTTAAGGCTTTCTTGAGCAACAATTTTAAGTTCAAAGACTTGGGAAGACCTTCTTACTTTCTGGGTTTGGAGATTGCTCGCAACACCAAAGGTATCTACCTATGTCAACGCAAATATGTTTTAGATTTACTTAAAGATGCAGGGCTTTTGAACTGTAGACCAGCTTCTACCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998741
ATGCAAGATAAAGGCAAGTTTCTTGGATTGGTTGTTTATGTTGATGATATATTGCTTGCTAGCAATGATGACAATTTGGTGGATTCTTTTAAGGCTTTCTTGAGCAACAATTTTAAGTTCAAAGACTTGGGAAGACCTTCTTACTTTCTGGGTTTGGAGATTGCTCGCAACACCAAAGGTATCTACCTATGTCAACGCAAATATGTTTTAGATTTACTTAAAGATGCAGGGCTTTTGAACTGTAGACCAGCTTCTACCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780133.1
MQDKGKFLGLVVYVDDILLASNDDNLVDSFKAFLSNNFKFKDLGRPSYFLGLEIARNTKGIYLCQRKYVLDLLKDAGLLNCRPASTPMESGKHLDLEEGPSLTDFTPYRRLVGRLLYLCLTRPDITFAVHNLSQFLSKPCEGHMAAAERILRYLKGTIGHGLFFDKNSTMDLSSFSDADWASCPATRRSVTGFAIFLGSSLISWKSKKQSTISRSSAEAEYRAMAQTSCEVTWVRNLLLEFGIRQSRATPLYCDNKAAVY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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