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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004622`

染色体: Chr08 坐标: 55764458-55766159 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004622`
名称	SmilChr08G004622
描述	uncharacterized SmilChr08G004622
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55764458 - 55766159 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998748`
GeneID	`130998748`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998748`
原始查询	`LOC130998748`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G15685` (AT5G15685) mutator transposase MUDRA protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721163] identity=25.2; qcov=0.717; evalue=4.64e-23; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=29.7; qcov=0.806; evalue=1.42e-35; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998748

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780140.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780140.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780140.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780140.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780140.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55764462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr8:55764493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,A22
`Chr8:55764496`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A5
`Chr8:55764496`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A5
`Chr8:55764507`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	33	A13,A21,A22,A5,B1,B109,B12,B138,B15,B26,B30,B46,B48,B49,B60,B61,B66,B72,B79,B82,B87,C10,C11,C18,C21,C33,C37,C41,C44,C54,C73,D4,D9
`Chr8:55764511`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	33	A13,A21,A22,A5,B1,B109,B12,B138,B15,B26,B30,B46,B48,B49,B60,B61,B66,B72,B79,B82,B87,C10,C11,C18,C21,C33,C37,C41,C44,C54,C73,D4,D9
`Chr8:55764536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr8:55764554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr8:55764579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B63
`Chr8:55764585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr8:55764639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B93,C59,C63
`Chr8:55764707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780140.1

459 aa

230

459

DBD_Tnp_Mut

MULE

PF03108 DBD_Tnp_Mut 208-271 aa PF10551 MULE 383-455 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780140.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	208	271	2.2e-07	31.1	MuDR family transposase
`XP_057780140.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	383	455	1.9e-10	41.7	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924157.1
ATGGGTAAGAATTTGATAATTACAGTCTGTGTTGAGGGTGGGGTTAAAGCTACAAAAGTTACAGATGACAAACAACAACCAAAGGAAATGGGGACTGTTAAGGGTAATGATGTTGAGGCTACTGATTGTGATGTTGAGGGGAATTTGGGCGATGCTGAGGGTAGTGAGAGTGACTGTGATGGTGATGGTGAGGGTAGTCAGACTGAGGGTTATGGCAGTGAGGGGCAATGTGGGGTTGAGGGTCAATTTGAGGGTTTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998748
ATGGGTAAGAATTTGATAATTACAGTCTGTGTTGAGGGTGGGGTTAAAGCTACAAAAGTTACAGATGACAAACAACAACCAAAGGAAATGGGGACTGTTAAGGGTAATGATGTTGAGGCTACTGATTGTGATGTTGAGGGGAATTTGGGCGATGCTGAGGGTAGTGAGAGTGACTGTGATGGTGATGGTGAGGGTAGTCAGACTGAGGGTTATGGCAGTGAGGGGCAATGTGGGGTTGAGGGTCAATTTGAGGGTTTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780140.1
MGKNLIITVCVEGGVKATKVTDDKQQPKEMGTVKGNDVEATDCDVEGNLGDAEGSESDCDGDGEGSQTEGYGSEGQCGVEGQFEGLQDKGRNDIDEESNIPRDVDDWGHLENATFSEIEDVINMDWGDNYISDEENIELRKKLKKVDSVFDLLNENDGFEADVEHTYASDYENETHEFVSEESDSDFEPRLRKKRLVYDPKCDHSKLEIVIGMHFQDGFQCREALTTWAVENGRYIRFRAVSKKKLLAKCTPLCPWKVFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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