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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004624`

染色体: Chr08 坐标: 55783025-55783408 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004624`
名称	SmilChr08G004624
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55783025 - 55783408 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998749`
GeneID	`130998749`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998749`
原始查询	`LOC130998749`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 2
产物	probable disease resistance RPP8-like protein 2
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=38; qcov=0.787; evalue=2.95e-16; confidence=low
Rice	`Os04g0118800` - identity=42.2; qcov=0.709; evalue=4.69e-16; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998749

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780141.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780141.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780141.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780141.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780141.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55783168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C54
`Chr8:55783188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,B96,D9
`Chr8:55783312`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C83
`Chr8:55783312`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C83
`Chr8:55783346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B57,C58
`Chr8:55783349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B57,C58
`Chr8:55783356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B63
`Chr8:55783365`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A6,B15,B20,C6,C7
`Chr8:55783365`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A6,B15,B20,C6,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780141.1

127 aa

127

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 47-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780141.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	47	119	2.2e-17	63.9	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924158.1
ATGGATCTTGTGAGAGAGAAAGTGTTGAAGGTGAAAGAGGAAAGGGGAGTCAGATATGAGCAGCCGACTGCTAATTCATCAAGATCTGTTGCCAGCAACCGAGAGGCGATTATGGTGGGATTTGGTGGCTACTTGCATCAGCTCTTGGATTTGCTCACCGGAAATCAATCTAGCCGCCAGATCATCTCAATCGTCGGTATGGGCGGTATTGGTAAGACTACTCTGGCCAAGAATACTTTTGAAAATTCAATTATTAAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998749
ATGGATCTTGTGAGAGAGAAAGTGTTGAAGGTGAAAGAGGAAAGGGGAGTCAGATATGAGCAGCCGACTGCTAATTCATCAAGATCTGTTGCCAGCAACCGAGAGGCGATTATGGTGGGATTTGGTGGCTACTTGCATCAGCTCTTGGATTTGCTCACCGGAAATCAATCTAGCCGCCAGATCATCTCAATCGTCGGTATGGGCGGTATTGGTAAGACTACTCTGGCCAAGAATACTTTTGAAAATTCAATTATTAAGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780141.1
MDLVREKVLKVKEERGVRYEQPTANSSRSVASNREAIMVGFGGYLHQLLDLLTGNQSSRQIISIVGMGGIGKTTLAKNTFENSIIKRHFDVRVWVSVSNDYNLSDIFLEALSHLKELTSTIEMDNEY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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