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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004662`

染色体: Chr08 坐标: 56105928-56106591 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004662`
名称	SmilChr08G004662
描述	uncharacterized SmilChr08G004662
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56105928 - 56106591 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998766`
GeneID	`130998766`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998766`
原始查询	`LOC130998766`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=50; qcov=0.618; evalue=5.82e-32; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=48.5; qcov=0.753; evalue=2.01e-35; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998766

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780155.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057780155.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780155.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780155.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780155.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56105932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,A3,C2
`Chr8:56105943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr8:56105952`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B13,C36,C43
`Chr8:56105952`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B13,C36,C43
`Chr8:56105955`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A13,A25,B11,B30,B45,B47,C28,C48,C56
`Chr8:56105958`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A13,A25,B11,B30,B45,B47,C28,C48,C56
`Chr8:56105994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,C62,C75
`Chr8:56106002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,C1,D1
`Chr8:56106054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,D8
`Chr8:56106060`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A13,A2,A9,B102,B106,B110,B117,B124,B128,B129,B16,B19,B22,B25,B5,B76,B8,B89,B99,C22,C28,C3,C31,C41,C51,C58,C61,C72
`Chr8:56106089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A18,A23,B105,B11,B110,B12,B30,B45,B47,B68,C28,C43,C48,C56,C65,C75,C76,D1
`Chr8:56106093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A4,B102,B111,B21,B36,B47,B49,B59,B86,C6,C71,D3,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780155.1

178 aa

178

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 36-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780155.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	36	150	8.7e-44	150.3	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924172.1
ATGACTCACTGCAATGCACGAAGCCAAACATGGATTCCCGAGAATGTTGGGGAGCCTAGACTGCATGCATTGAGGATGGAAGAATTGCCCAGTGGCTTGGCATGGCACTCCACGCTGTTCAATGACGTTTTATCGGGCACTGAAGCGGCGGTGCACTTCGTCGCCAACAATGCTCACTACACTAGAGGCTACTACTTAACTGACGGCATCTATCCTGATTGGCCGGTGTTCGTCAAAAGCTTCCAGTTTCCAAACGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998766
ATGACTCACTGCAATGCACGAAGCCAAACATGGATTCCCGAGAATGTTGGGGAGCCTAGACTGCATGCATTGAGGATGGAAGAATTGCCCAGTGGCTTGGCATGGCACTCCACGCTGTTCAATGACGTTTTATCGGGCACTGAAGCGGCGGTGCACTTCGTCGCCAACAATGCTCACTACACTAGAGGCTACTACTTAACTGACGGCATCTATCCTGATTGGCCGGTGTTCGTCAAAAGCTTCCAGTTTCCAAACGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780155.1
MTHCNARSQTWIPENVGEPRLHALRMEELPSGLAWHSTLFNDVLSGTEAAVHFVANNAHYTRGYYLTDGIYPDWPVFVKSFQFPNDEKKRRFKLMQEAARKDVERAFGVLQARWGIIKGSSRLWKQEHMSAIMFTCIILHNMIIGDEGETGATFDGDGSEGSSSLPQTQSTIWPGVQA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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