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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004725`

染色体: Chr08 坐标: 56644823-56646539 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G004725`
名称	SmilChr08G004725
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56644823 - 56646539 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998788`
GeneID	`130998788`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130998788`
原始查询	`LOC130998788`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
拟南芥	`AT3G07500` (AT3G07500) Far-red impaired responsive (FAR1) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819938] identity=46.07; qcov=0.674; evalue=1.52e-50; confidence=medium
水稻	`Os03g0655600` - identity=48.78; qcov=0.424; evalue=9.25e-30; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998788

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞核	1.00000	`SmilChr08G004725.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56644825`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	B101,B111,B115,B131,B14,B20,B3,B57,B78,C33,C6,C85,D10
`Chr8:56644828`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	111	A20,A23,A24,A5,A6,A7,B100,B105,B11,B111,B114,B118,B12,B120,B124,B125,B126,B128,B129,B130,B132,B136,B137,B138,B139,B15,B20,B23,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B38,B39,B40,B42,B44,B45,B49,B5,B51,B52,B56,B57,B59,B6,B60,B63,B64,B65,B66,B69,B71,B78,B80,B81,B83,B90,B92,B94,B96,B97,C10,C13,C16,C18,C2,C20,C21,C22,C29,C3,C31,C33,C35,C36,C4,C41,C42,C44,C45,C46,C48,C50,C51,C53,C58,C59,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C7,C70,C71,C73,C75,C8,C83,C84,C9,D4,D5,D6,D9
`Chr8:56644836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:56645416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:56645451`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B139,C11
`Chr8:56645451`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B139,C11
`Chr8:56645479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C34
`Chr8:56645525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr8:56645541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B37,C35,D5
`Chr8:56645544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C34
`Chr8:56645592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr8:56645607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G004725.1

来源蛋白: XP_057780178.1

264 aa

132

264

FAR1

PF03101 FAR1 101-189 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`SmilChr08G004725.1` XP_057780178.1	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	101	189	4.9e-27	95.2	FAR1 DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924195.1
ATGAAAATTTTCCCCATTTTGTTTGGGAGAAATTATGATGATAAACCATGGTTAAAACTTAAAAGTGTACTTGTTGATATTTGGGTGAGTTTTGATCCAAATGAGGCTGCAAATTATAAACTGGATTATTCAGATGTGGATGATAAGCTGGTGGAAGTTGGGAGTGATATCTGTATGTCTGATGGGGGGGAGATGGTAAATTTTTACGACGAAAAGGACTTTTCGTCGCAAGAACTGTGTTTGAACGTGGAAGCACCGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

SmilChr08G004725.1 (XP_057780178.1)
ATGAAAATTTTCCCCATTTTGTTTGGGAGAAATTATGATGATAAACCATGGTTAAAACTTAAAAGTGTACTTGTTGATATTTGGGTGAGTTTTGATCCAAATGAGGCTGCAAATTATAAACTGGATTATTCAGATGTGGATGATAAGCTGGTGGAAGTTGGGAGTGATATCTGTATGTCTGATGGGGGGGAGATGGTAAATTTTTACGACGAAAAGGACTTTTCGTCGCAAGAACTGTGTTTGAACGTGGAAGCACCGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

SmilChr08G004725.1 (XP_057780178.1)
MKIFPILFGRNYDDKPWLKLKSVLVDIWVSFDPNEAANYKLDYSDVDDKLVEVGSDICMSDGGEMVNFYDEKDFSSQELCLNVEAPRVGMEFESEESAMAYYDAYAKRVGFIIRIGNCHRSSLNGSVISRRFVCNKEGFRVKSSKVKRVEVRKPRAVTREGCKAMVMIRKEDSGAWIIAKLETQHSHPLGVSPGKPHRGPLRVQSQDEKDKRIRELSTELHRTKQKLAECQKQLSAILSDVELHVDHLTRSVQHLVQNVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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