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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004726`

染色体: Chr08 坐标: 56649826-56650299 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004726`
名称	SmilChr08G004726
描述	stearoyl-[acyl-carrier-protein] 9-desaturase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56649826 - 56650299 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998789`
GeneID	`130998789`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998789`
原始查询	`LOC130998789`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stearoyl-[acyl-carrier-protein] 9-desaturase, chloroplastic-like
产物	stearoyl-[acyl-carrier-protein] 9-desaturase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G43710` (SSI2) Plant stearoyl-acyl-carrier-protein desaturase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818973] identity=69.1; qcov=1.05; evalue=1.16e-47; confidence=medium
Rice	`Os01g0919900` (OsSSI2) - identity=66.4; qcov=1.05; evalue=9.09e-46; confidence=medium
GO	GO:0006631 (fatty acid metabolic process); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0045300 (stearoyl-[ACP] desaturase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03405 (FA_desaturase_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998789

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780179.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057780179.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057780179.1`
4	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.20000	`XP_057780179.1`
5	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057780179.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56649865`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	94	A13,A14,A16,A18,A19,A22,A25,A4,A7,A8,B1,B100,B101,B102,B104,B107,B109,B113,B114,B115,B119,B120,B123,B125,B127,B140,B16,B21,B25,B27,B33,B36,B4,B42,B43,B44,B45,B46,B48,B49,B50,B51,B52,B54,B55,B59,B6,B60,B63,B64,B67,B68,B74,B76,B77,B79,B8,B83,B9,B93,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C16,C17,C24,C27,C28,C30,C32,C37,C38,C40,C43,C48,C5,C54,C55,C56,C63,C67,C68,C69,C7,C72,C81,C83,D4,D7,D8
`Chr8:56649884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,D7
`Chr8:56649888`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A11,A22,B117,B138,B54,C15,C4,C57,D11
`Chr8:56649891`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B131,D10,D11
`Chr8:56649891`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B131,D10,D11
`Chr8:56649894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr8:56649895`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	80	A11,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A3,A5,A6,A7,B1,B105,B106,B109,B110,B113,B114,B115,B117,B120,B127,B139,B15,B16,B2,B36,B4,B42,B50,B52,B55,B58,B59,B6,B63,B70,B74,B76,B77,B8,B82,B85,B86,B87,B9,B91,C1,C11,C13,C15,C16,C17,C18,C19,C22,C23,C30,C37,C38,C4,C40,C47,C49,C56,C57,C61,C69,C7,C78,C8,C83,D1,D3,D4,D6,D7,D8
`Chr8:56649902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A18,A24,B100,B102,B11,B111,B112,B124,B27,B30,B64,C1,C13,C20,C33,C35,C65,C75,D3
`Chr8:56649906`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A18,A24,B100,B11,B111,B112,B124,B27,B30,B64,C1,C13,C20,C33,C35,C65,C75,D3
`Chr8:56649908`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C13
`Chr8:56649908`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C13
`Chr8:56649909`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A18,A24,B100,B11,B111,B112,B124,B27,B64,C1,C20,C33,C35,C65,C75,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780179.1

105 aa

105

FA_desaturase_2

PF03405 FA_desaturase_2 1-36 aa PF03405 FA_desaturase_2 35-87 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780179.1`	Pfam	`PF03405`	FA_desaturase_2	Domain	1	36	8e-33	114.4	Fatty acid desaturase
`XP_057780179.1`	Pfam	`PF03405`	FA_desaturase_2	Domain	35	87	8e-33	114.4	Fatty acid desaturase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924196.1
ATGCTCAACACCTTGGATGGCATGAGGGATGAGACGGGGGCGAGCTTAACTCCTTGGGCAGTCTGGACGAGGGTGTGGACTGCTGAGGAGAATATGCACGGATATCTGATCGGGTCGGGAATGGACTTGAGGACAGAAAACAGCCCGTACCTCGGATTCATCTACACATCCTTCCAAGAAAGGGCTACATTTGTGTCCCACGGAAACACAGCCCGACAAGCCCGGGAGCACGGGAACATCAAGCTGGCTCAGATATGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998789
ATGCTCAACACCTTGGATGGCATGAGGGATGAGACGGGGGCGAGCTTAACTCCTTGGGCAGTCTGGACGAGGGTGTGGACTGCTGAGGAGAATATGCACGGATATCTGATCGGGTCGGGAATGGACTTGAGGACAGAAAACAGCCCGTACCTCGGATTCATCTACACATCCTTCCAAGAAAGGGCTACATTTGTGTCCCACGGAAACACAGCCCGACAAGCCCGGGAGCACGGGAACATCAAGCTGGCTCAGATATGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780179.1
MLNTLDGMRDETGASLTPWAVWTRVWTAEENMHGYLIGSGMDLRTENSPYLGFIYTSFQERATFVSHGNTARQAREHGNIKLAQICGDDFFLKLMTYLAPEDVVS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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