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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004738`

染色体: Chr08 坐标: 56773162-56773866 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004738`
名称	SmilChr08G004738
描述	uncharacterized SmilChr08G004738
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56773162 - 56773866 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998794`
GeneID	`130998794`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998794`
原始查询	`LOC130998794`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666]; symbol=AT3G29765; hit=AT3G29765; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666]; symbol=AT3G29765; hit=AT3G29765; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G29765` (AT3G29765) ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666] identity=52.4; qcov=0.996; evalue=3.11e-83; confidence=high
Rice	`Os02g0301400` - identity=36.6; qcov=1; evalue=7.12e-48; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998794

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780184.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057780184.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780184.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780184.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780184.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56773241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,B79,D11
`Chr8:56773257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,C7,D8
`Chr8:56773286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr8:56773363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:56773389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr8:56773460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B99,C17
`Chr8:56773584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr8:56773713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr8:56773715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr8:56773741`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C35,D5
`Chr8:56773741`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C35,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780184.1

234 aa

117

234

DUF4371

PF14291 DUF4371 2-31 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780184.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	2	31	2.6e-09	37.7	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924201.1
ATGTCTTTACTTGTTGAACATTCATTGAGTCCATCTAAGATTCGAGGGCAAGGGTATGATGGGGCTAGTAACATGAAGGGTGAGAAAAATGGTCTCAAGACCTTAATTATGCAAGACACCCCAAGTGCCTACTATGTTCATTGTTTTGCTCATCAACTTCAACTAACTCTTGTAGCCGCTGCTAAAAAGAACAATGATTGTGTTTGGCTCTTTGATACGCTTGCAACGTTGTTGAATGTGATTGGAGTTTCTTGTAAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998794
ATGTCTTTACTTGTTGAACATTCATTGAGTCCATCTAAGATTCGAGGGCAAGGGTATGATGGGGCTAGTAACATGAAGGGTGAGAAAAATGGTCTCAAGACCTTAATTATGCAAGACACCCCAAGTGCCTACTATGTTCATTGTTTTGCTCATCAACTTCAACTAACTCTTGTAGCCGCTGCTAAAAAGAACAATGATTGTGTTTGGCTCTTTGATACGCTTGCAACGTTGTTGAATGTGATTGGAGTTTCTTGTAAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780184.1
MSLLVEHSLSPSKIRGQGYDGASNMKGEKNGLKTLIMQDTPSAYYVHCFAHQLQLTLVAAAKKNNDCVWLFDTLATLLNVIGVSCKRREMLREFQAQKIAEALEVGELDTGFGLNQELGLKRPGETRWGSHYKTLVNVMNLFSTIVKFLVMIGENGSNSNDKVKAQGILYPLESFDFIFMAQLMSTILGYTNDLCLALQRKDQDIVGAMRLVTLTKVVLQKMRENGWEALLDKV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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