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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004882`

染色体: Chr08 坐标: 57908117-57910710 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004882`
名称	SmilChr08G004882
描述	uncharacterized SmilChr08G004882
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57908117 - 57910710 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998831`
GeneID	`130998831`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998831`
原始查询	`LOC130998831`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ER lumen protein retaining receptor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822107]; symbol=AT3G25160; hit=AT3G25160; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ER lumen protein retaining receptor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822107]; symbol=AT3G25160; hit=AT3G25160; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G25160` (AT3G25160) ER lumen protein retaining receptor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822107] identity=61.9; qcov=0.945; evalue=1.72e-113; confidence=high
Rice	`Os09g0534200` (OsGL1B) - identity=57; qcov=0.956; evalue=6.72e-106; confidence=high
GO	GO:0006621 (protein retention in ER lumen); GO:0016020 (membrane); GO:0046923 (ER lumen protein retrieval receptor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00810 (ER_lumen_recept)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998831

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057780219.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057780219.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057780219.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057780219.1`
5	Endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment	Endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment	0.20000	`XP_057780219.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57908137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:57908197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr8:57908206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,B97
`Chr8:57908237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B66,B77
`Chr8:57909078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B124,C4,C5
`Chr8:57909081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,D1
`Chr8:57909086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B19,B6,C6
`Chr8:57909144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,D10
`Chr8:57909145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr8:57909554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B108,B119,C3
`Chr8:57909766`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B103,B19
`Chr8:57909766`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B103,B19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780219.1

275 aa

138

275

ER_lumen_recept

PF00810 ER_lumen_recept 68-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780219.1`	Pfam	`PF00810`	ER_lumen_recept	Repeat	68	210	3.8e-42	145.2	ER lumen protein retaining receptor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924236.1
ATGTGGACGAGGATTACGGCGCCGTTTTACAAGATTCTTGCATGGCTGCGGCGGCGGTCAACGATAGTCAAGGCCCTCCTCGCGGCGGCGGCGGCGCTCTGCGCGGTGGCGGCGCTGAAACTGTCCCATTTCTTCGTCGCGTCTGAGGCGATCCATTTCCTTGGGATTTTGGTGTTGATTTATAAGCTCACCACTCTCAAAACGTGCTCCGGGCTCTCCTTGAAGGCACAAGAGCTTACAGCTACATTCTTGACATCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998831
ATGTGGACGAGGATTACGGCGCCGTTTTACAAGATTCTTGCATGGCTGCGGCGGCGGTCAACGATAGTCAAGGCCCTCCTCGCGGCGGCGGCGGCGCTCTGCGCGGTGGCGGCGCTGAAACTGTCCCATTTCTTCGTCGCGTCTGAGGCGATCCATTTCCTTGGGATTTTGGTGTTGATTTATAAGCTCACCACTCTCAAAACGTGCTCCGGGCTCTCCTTGAAGGCACAAGAGCTTACAGCTACATTCTTGACATCAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780219.1
MWTRITAPFYKILAWLRRRSTIVKALLAAAAALCAVAALKLSHFFVASEAIHFLGILVLIYKLTTLKTCSGLSLKAQELTATFLTSRLCCSFFMERDIHTVLDCLTLVSTLWIVYKMRFELKSTYISKLDNMPLYYVIVPCAILAMLVHPRTYQGRPVRMLWAFAVYLESISVLPQLKMIQNAKIIEPFTAHYVFALGIARFLGCAHWIIKVYKSSGRYLYLVGAGYIWFPMVLLAEIVQTFILADFCYYYIKGLMDGRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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