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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004945`

染色体: Chr08 坐标: 58324542-58325330 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004945`
名称	SmilChr08G004945
描述	subtilisin-like protease SBT3.18
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58324542 - 58325330 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998840`
GeneID	`130998840`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998840`
原始查询	`LOC130998840`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease SBT3.18
产物	subtilisin-like protease SBT3.18
Arabidopsis	`AT4G26330` (UNE17) Subtilisin-like serine endopeptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828739] identity=52.7; qcov=0.962; evalue=1.7e-75; confidence=high
Rice	`Os03g0158700` (OsSub27) - identity=50.5; qcov=0.945; evalue=6.92e-77; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998840

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057780228.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057780228.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780228.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780228.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780228.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58324551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B13,B84
`Chr8:58324564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B65,B91
`Chr8:58324568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr8:58324571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B2,B7
`Chr8:58324574`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C87
`Chr8:58324574`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C87
`Chr8:58324592`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C57
`Chr8:58324592`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C57
`Chr8:58324622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr8:58324767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr8:58324794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,B98,C8
`Chr8:58324826`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780228.1

235 aa

118

235

Peptidase_S8

fn3_6

PF00082 Peptidase_S8 1-36 aa PF17766 fn3_6 117-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780228.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	1	36	1.6e-07	31.6	Subtilase family
`XP_057780228.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	117	213	8.8e-26	90.7	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924245.1
ATGTCATGTCCCCATGTCTCCGGTGTCGTCGCGCTTCTCAAATCTACACATCCACATTGGTCTCCTGTTGCAATTAGATCCGCCCTCTTGACAACAGCTTACAACGTGGACATATATGGCGACGATATAGCAATTGAAGCGTCGGAGAAATCTGCGGATCCGTTCGACATCGGATTGGGACACATTAATCCACTAAAGGCCTTGGATCCGGGGCTTGTCTACGATGCCACAATGACGGACTATGTTCATTTTCTATGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998840
ATGTCATGTCCCCATGTCTCCGGTGTCGTCGCGCTTCTCAAATCTACACATCCACATTGGTCTCCTGTTGCAATTAGATCCGCCCTCTTGACAACAGCTTACAACGTGGACATATATGGCGACGATATAGCAATTGAAGCGTCGGAGAAATCTGCGGATCCGTTCGACATCGGATTGGGACACATTAATCCACTAAAGGCCTTGGATCCGGGGCTTGTCTACGATGCCACAATGACGGACTATGTTCATTTTCTATGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780228.1
MSCPHVSGVVALLKSTHPHWSPVAIRSALLTTAYNVDIYGDDIAIEASEKSADPFDIGLGHINPLKALDPGLVYDATMTDYVHFLCNMGYSEAQIQAMHICPLLIIMCPDKPEPNWNINYPSITVWDLRYATTVKRSVRNVGHSKTGVYYVSVVKPHGLEVVVWPKVLVFSPFKEEITYHVTMSPLKISQGRYDFGSIMWSDGFHHVRSPLVVQVNTNAPLTATIVNASNSLSDI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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