当前解析结果
SmilChr08G004946| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004946 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004946 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G004946 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 58330569 - 58331639 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998841 |
|---|---|
| GeneID | 130998841 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998841 |
| 原始查询 | LOC130998841 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998841 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057780229.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057780229.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780229.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780229.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057780229.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:58330578 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr8:58330580 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C37,C6 |
Chr8:58330652 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 16 | A1,B109,B110,B20,B22,B39,B41,B43,B55,B72,B75,B86,B9,C37,C38,C39 |
Chr8:58330682 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B10,B118,B6,C75 |
Chr8:58330871 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B30,B8,C19,C46,C80 |
Chr8:58330872 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A21,C12 |
Chr8:58330874 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,B57 |
Chr8:58330882 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B59,B67,C64,D7 |
Chr8:58330885 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,C85 |
Chr8:58330890 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr8:58330891 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B13,B44,C62 |
Chr8:58330892 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 14 | A21,A25,B128,B14,B18,B45,B71,B83,C21,C27,C35,C39,C48,C63 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。