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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004029`

染色体: Chr01 坐标: 58701536-58703925 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004029`
名称	SmilChr01G004029
描述	histidine-containing phosphotransfer protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58701536 - 58703925 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998851`
GeneID	`130998851`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998851`
原始查询	`LOC130998851`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histidine-containing phosphotransfer protein 1-like
产物	histidine-containing phosphotransfer protein 1-like
Arabidopsis	`AT3G21510` (AHP1) histidine-containing phosphotransmitter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821705] identity=65.6; qcov=0.993; evalue=5.65e-65; confidence=high
Rice	`Os05g0521300` (OsPHP3) - identity=49.7; qcov=0.967; evalue=4.36e-48; confidence=medium
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway); GO:0009927 (histidine phosphotransfer kinase activity); GO:0016310 (phosphorylation); GO:0043424 (protein histidine kinase binding)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01627 (Hpt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998851

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780244.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057780244.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780244.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057780244.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780244.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58702185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C26
`Chr1:58703136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B56,B96,D4,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780244.1

152 aa

152

Hpt

PF01627 Hpt 45-124 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780244.1`	Pfam	`PF01627`	Hpt	Domain	45	124	7.8e-17	62.0	Hpt domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924261.1
AGCCAGACAAATAAAAGTACAATTAAAACGATTTGCGTTTTTCCCAAAATAAAAGCTTACGTCACATCATTGGACTGCAACAAGACGAAAGAATTATCATTGAATAATTTCCACTTTAGACGAAAAACTTATCATTAATAATTTTCACGTAAGACGAAAAAACTAATCATTAATTAATTTCCACTTATGAATACTTAATTACCACTAATTACCTGTCTATTGCTTTGGCAAGTCAATTTCTCCCACGTTTAAATCACACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998851
ATGGAGATTGTGGGGCAGCTGCGGAAACAGTATGTTGACTTCTCTACTTCTCTTTATCGCGAGGGTTTCTTGGATGAACAGTATCTACAGCTGCAGAAATTGCAAGATGAGAGCAACCCTGATTTTGTGTGTGAAGTTGTCTCACTCTTCTTTGAGGATTCTGAGAAGCTTCTGAATAATTTAGCAACTGCTCTTCAGCAGCAGGTTGTAGATTTCAAGCAGGTTGATGCCCATGTTCATCAGTTCAAAGGCAGCAGTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780244.1
MEIVGQLRKQYVDFSTSLYREGFLDEQYLQLQKLQDESNPDFVCEVVSLFFEDSEKLLNNLATALQQQVVDFKQVDAHVHQFKGSSSSIGAQRVKNMCVAFRNFCEEKNLDGCLRCLQQVKHEYFLVKNKLEALFRLERQIVEAGGTVPAIA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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