当前解析结果
SmilChr08G004103| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004103 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004103 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G004103 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 49807712 - 49815311 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998852 |
|---|---|
| GeneID | 130998852 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998852 |
| 原始查询 | LOC130998852 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998852 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057780255.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057780249.1 |
| 3 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057780251.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057780255.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780249.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:49807844 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A8,C83 |
Chr8:49807880 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr8:49807928 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 19 | A11,A25,A3,A4,B10,B107,B133,B16,B19,B24,B34,B36,B87,B94,C10,C26,C74,C79,C80 |
Chr8:49807940 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A8,C83 |
Chr8:49807950 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B33,B49,C32,C68 |
Chr8:49807950 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B33,B49,C32,C68 |
Chr8:49807957 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B132,B47,B55 |
Chr8:49807965 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B122,B128,C12,C22 |
Chr8:49808270 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B100,B132,B47,B55 |
Chr8:49808276 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B132,B47,B55 |
Chr8:49808276 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B132,B47,B55 |
Chr8:49808451 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B110 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
16 records
下载 cDNA FASTA13 records
下载 CDS FASTA13 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。