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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004106`

染色体: Chr08 坐标: 49833980-49834968 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004106`
名称	SmilChr08G004106
描述	protein MAIN-LIKE 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	49833980 - 49834968 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998856`
GeneID	`130998856`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998856`
原始查询	`LOC130998856`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MAIN-LIKE 2-like
产物	protein MAIN-LIKE 2-like
Arabidopsis	`AT2G04865` (AT2G04865) Aminotransferase-like, plant mobile domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815033] identity=25.9; qcov=0.905; evalue=2.34e-12; confidence=low
Rice	`Os07g0507500` - identity=27; qcov=0.93; evalue=1.11e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10536 (PMD); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998856

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780265.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057780265.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780265.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780265.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780265.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:49834093`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B130,D10
`Chr8:49834093`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B130,D10
`Chr8:49834094`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B126,B9,C15,C44,C67
`Chr8:49834094`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B126,B9,C15,C44,C67
`Chr8:49834098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr8:49834112`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B105,B86,C76
`Chr8:49834112`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B105,B86,C76
`Chr8:49834115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B19,B26,C37
`Chr8:49834115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B26,C37
`Chr8:49834116`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B105,B86,C76
`Chr8:49834116`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B105,B86,C76
`Chr8:49834128`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B121

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780265.1

243 aa

122

243

DUF8566

PMD

PF29561 DUF8566 40-191 aa PF10536 PMD 70-200 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780265.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	40	191	2.3e-11	44.6	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057780265.1`	Pfam	`PF10536`	PMD	Domain	70	200	1.3e-14	54.9	Plant mobile domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924282.1
TTGCAACTTGTTGGTTTTTTTAGATCTTCACACTCTTGATTGCTTGCCATTTGACTTATAATGGTGATTTCAGATCATGGGATTCAAATTTGAAGATCACATAGAGTCAATATTTACATGGAAGCTTGATAGCCGAGTCGAAGAGAAAGTAAAAGACACATGTCTGTACAAGTATGTGTCTAATCTTCGTAATATCTGGTTACCATCAAGGCACATGAAAGATCAGATAAACAGCTATGATGCTACAGACAAATCCTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998856
ATGGGATTCAAATTTGAAGATCACATAGAGTCAATATTTACATGGAAGCTTGATAGCCGAGTCGAAGAGAAAGTAAAAGACACATGTCTGTACAAGTATGTGTCTAATCTTCGTAATATCTGGTTACCATCAAGGCACATGAAAGATCAGATAAACAGCTATGATGCTACAGACAAATCCTTCTCCATAAATGGGAAAAAAATTTACTTGGGTCTTGAAGATGTTTTCTTCATAACCGGTCTTCCTATTAAAGGGCGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780265.1
MGFKFEDHIESIFTWKLDSRVEEKVKDTCLYKYVSNLRNIWLPSRHMKDQINSYDATDKSFSINGKKIYLGLEDVFFITGLPIKGRPVTVDESLLKDEFEEYFGLPTSKGTTFSVPLLKEFESLPEIASDDRITKSTRAYLLYILGCVIFPSSWRKFELPYAFLHFVKNVEDVDKYAWGAAVLANTHNALKRKTQSLLGANGLLLSIFMMVHIPSIVMCFPNPNSWPLCLDYWNCNNRSAFAK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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