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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004127`

染色体: Chr08 坐标: 50116983-50118456 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004127`
名称	SmilChr08G004127
描述	late embryogenesis abundant protein 47-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50116983 - 50118456 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998878`
GeneID	`130998878`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998878`
原始查询	`LOC130998878`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late embryogenesis abundant protein 47-like
产物	late embryogenesis abundant protein 47-like
Arabidopsis	`AT5G27980` (AT5G27980) Seed maturation protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832868] identity=69.5; qcov=0.675; evalue=1e-54; confidence=high
Rice	`Os06g0341300` (OsLEA33) - identity=53.2; qcov=0.593; evalue=7.44e-25; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04927 (SMP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998878

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780284.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057780284.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057780284.1`
4	Cell projection	细胞突起	0.20000	`XP_057780284.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780284.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50117422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B140,B35,C22,C81
`Chr8:50118055`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B41
`Chr8:50118055`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B41
`Chr8:50118245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:50118267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:50118331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:50118370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780284.1

209 aa

104

209

SMP

PF04927 SMP 75-132 aa PF04927 SMP 140-197 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780284.1`	Pfam	`PF04927`	SMP	Family	75	132	1.6e-47	160.3	Seed maturation protein
`XP_057780284.1`	Pfam	`PF04927`	SMP	Family	140	197	1.6e-47	160.3	Seed maturation protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924301.1
CATGCAATGTTTATATATATGTACATATCCACAAATATAGATCTCTTCAAATTTTGAACAATCAAAATCAAACTTGAAAATATGAGCCAAGAACAACCAGTGAAACATGTTCAAGATACAATTAGGGAATTGAATGCTCAAGAAGCAGCCAGCCATGTACAAGCACAAAACACCTCAGGCTCCTCCACTCCTACCAACCCTCATAGTAATGCCGTCGCTAGCCAGAAGGAACCCGTCGGCGTTCAGGGGATCAAGGAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998878
ATGAGCCAAGAACAACCAGTGAAACATGTTCAAGATACAATTAGGGAATTGAATGCTCAAGAAGCAGCCAGCCATGTACAAGCACAAAACACCTCAGGCTCCTCCACTCCTACCAACCCTCATAGTAATGCCGTCGCTAGCCAGAAGGAACCCGTCGGCGTTCAGGGGATCAAGGAGATCCAATCAAGCCCACTAGGGTCACGGACAGAGCAGCGAGGGGAAATCACCATCGGTGAAGCACTCGAAGCTACTGCTCTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780284.1
MSQEQPVKHVQDTIRELNAQEAASHVQAQNTSGSSTPTNPHSNAVASQKEPVGVQGIKEIQSSPLGSRTEQRGEITIGEALEATALTAGHRPVDYSDAAAIQAAEVRATGRTNIVPGGVAAAAQSAATRNARLPRDEDKTKLGEILSDASSKLPSDKPVTRRDAEGVIGAELRNDPNLCTRPGGVAASVAAAARLNQTNASHNNQNKTN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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