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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004137`

染色体: Chr08 坐标: 50396817-50400469 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004137`
名称	SmilChr08G004137
描述	uncharacterized SmilChr08G004137
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50396817 - 50400469 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998884`
GeneID	`130998884`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998884`
原始查询	`LOC130998884`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SNARE-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838106]; symbol=AT1G15370; hit=AT1G15370; species=arabidopsis; confidence=high
产物	SNARE-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838106]; symbol=AT1G15370; hit=AT1G15370; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G15370` (AT1G15370) SNARE-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838106] identity=85.6; qcov=0.993; evalue=1.34e-92; confidence=high
Rice	`Os03g0856200` (OsKu80) - identity=81.5; qcov=0.993; evalue=1.59e-89; confidence=high
GO	GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum); GO:0006891 (intra-Golgi vesicle-mediated transport); GO:0030126 (COPI vesicle coat)
KEGG	-
Pfam	PF01217 (Clat_adaptor_s)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998884

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057780289.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057780289.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057780289.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057780289.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057780289.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50399539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,C52,C7,D1
`Chr8:50399543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780289.1

147 aa

147

Clat_adaptor_s

PF01217 Clat_adaptor_s 1-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780289.1`	Pfam	`PF01217`	Clat_adaptor_s	Domain	1	137	7.5e-06	26.7	Clathrin adaptor complex small chain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924306.1
CAACTTTGTCTCTTCCCTTTAAATAAGAAGACGAAATTCCCACTTTACCCCCGATGCCCATATACGTTGTTATTTTTTCAAATTGAAAGGGAATTTCTCGAGCTCCACATCTAACGGCTGCTATTACTTGTCTAGCCACCAAGAAAGCAATCACAGCCGTCCGATCTCTTCGAGGGTTTAGTTACAATCCCCTCGCCTCGCACGCCTCCTTCGTGTTTATTTCGCTCTCTCTCAACTGGGAAGAAACCGTTTCGCTAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998884
ATGTTGCTCGCAGTCCTGATCGCAAATTCGGAAGGCAATATTCTTGTGGAACGTTTTAATGGTGTTCCGGCAGAGGAACGTTTACATTGGAGATCTTTCTTAGTGAAACTGGGAGTAGATAATCTCAGAGGAGTCAAGAATGAGGAGCTCCTTGTTGCTAATCACAAGTCGGTGTATATTGTATACACAGTGCTTGGTGATGTCAGTATATTCGTTGTTGGCAAGGATGAATACGATGAACTTGCCTTGTCAGAAGCTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780289.1
MLLAVLIANSEGNILVERFNGVPAEERLHWRSFLVKLGVDNLRGVKNEELLVANHKSVYIVYTVLGDVSIFVVGKDEYDELALSEAIFVITSALKDVCGKPPTERLFLDKYGKICLCLDEIVWKGLLENTDKDRIKRLIRLKPPTDF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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