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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004140`

染色体: Chr08 坐标: 50414449-50420087 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004140`
名称	SmilChr08G004140
描述	YTH domain-containing protein ECT1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50414449 - 50420087 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998886`
GeneID	`130998886`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998886`
原始查询	`LOC130998886`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	YTH domain-containing protein ECT1-like
产物	YTH domain-containing protein ECT1-like
Arabidopsis	`AT1G09810` (ECT11) evolutionarily conserved C-terminal region 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837511] identity=49.2; qcov=0.616; evalue=2.88e-104; confidence=high
Rice	`Os01g0679900` (B1144G04.45-2) - identity=41.6; qcov=0.826; evalue=2.77e-105; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0061157 (mRNA destabilization)
KEGG	-
Pfam	PF04146 (YTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998886

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780290.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.80000	`XP_057780290.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.80000	`XP_057780294.1`
4	P-body	P-body	0.40000	`XP_057780294.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780290.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50416235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:50418135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B46
`Chr8:50418623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:50418704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B10,B120,C48
`Chr8:50419406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr8:50419650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C71
`Chr8:50419661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780290.1

563 aa

282

563

YTH

PF04146 YTH 341-483 aa

XP_057780291.1

563 aa

282

563

YTH

PF04146 YTH 341-483 aa

XP_057780292.1

563 aa

282

563

YTH

PF04146 YTH 341-483 aa

XP_057780293.1

563 aa

282

563

YTH

PF04146 YTH 341-483 aa

XP_057780294.1

541 aa

270

541

YTH

PF04146 YTH 319-461 aa

XP_057780296.1

541 aa

270

541

YTH

PF04146 YTH 319-461 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780290.1`	Pfam	`PF04146`	YTH	Domain	341	483	1.9e-45	154.6	YT521-B-like domain
`XP_057780291.1`	Pfam	`PF04146`	YTH	Domain	341	483	1.9e-45	154.6	YT521-B-like domain
`XP_057780292.1`	Pfam	`PF04146`	YTH	Domain	341	483	1.9e-45	154.6	YT521-B-like domain
`XP_057780293.1`	Pfam	`PF04146`	YTH	Domain	341	483	1.9e-45	154.6	YT521-B-like domain
`XP_057780294.1`	Pfam	`PF04146`	YTH	Domain	319	461	1.8e-45	154.7	YT521-B-like domain
`XP_057780296.1`	Pfam	`PF04146`	YTH	Domain	319	461	1.8e-45	154.7	YT521-B-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924307.1
CAACTTTGTCTCTTCCCTTTAAATAAGAAGACGAAATTCCCACTTTACCCCCGATGCCCATATACGTTGTTATTTTTTCAAATTGAAAGGGAATTTCTCGAGCTCCACATCTAACGGCTGCTATTACTTGTCTAGCCACCAAGAAAGCAATCACAGCCGTCCGATCTCTTCGAGGGTTTAGTTACAATCCCCTCGCCTCGCACGCCTCCTTCGTGTTTATTTCGCTCTCTCTCAACTGGGAAGAAACCGTTTCGCTAATT...

XM_057924310.1
TTAAATAAGAAGACGAAATTCCCACTTTACCCCCGATGCCCATATACGTTGTTATTTTTTCAAATTGAAAGGGAATTTCTCGAGCTCCACATCTAACGGCTGCTATTACTTGTCTAGCCACCAAGAAAGCAATCACAGCCGTCCGATCTCTTCGAGGGTTTAGTTACAATCCCCTCGCCTCGCACGCCTCCTTCGTGTTTATTTCGCTCTCTCTCAACTGGGAAGAAACCGTTTCGCTAATTCGTATATCTGCAGCGGTT...

CDS

6 records

下载 CDS FASTA

LOC130998886
ATGGCCGGAGACAAGAAAATAGAGACATATCAGCTAAACGCCCCTGTCTCAAAGTCTGAATCATCAATGAATATTCCTGATAAAGATATGGTGAAAGATGGATTACCATCCGAGTCTGTGTCATCTGTATCTGCTGGGGCCAATGCTGCATCTGGAAAAGGTGCTACTGATCAACCTGTTACTTCAGAGCAGGGTGCCTATTATTCGCCTACCAACTGTTATGATTATTATTACCCAGGATACAATGGAAACTTTACCCA...

Protein

6 records

下载 Protein FASTA

XP_057780290.1
MAGDKKIETYQLNAPVSKSESSMNIPDKDMVKDGLPSESVSSVSAGANAASGKGATDQPVTSEQGAYYSPTNCYDYYYPGYNGNFTQSDDKGFPNTPGGSYAGIQQDNSSLLYYVPSYGPYSTGFVGVDGKQAYTSSEYLQQPCSYGSEAFPCYTYDLAYAGNGSSSNKSGSVKSAGTSGSGRSNGFNVAKTNNNLSSKSSALPYNSRTQQPNSSRSIYQNQSLHPLSKLGTGFQSSGLMRGIQPAGNYSSFTSRNSRSF...

XP_057780291.1
MAGDKKIETYQLNAPVSKSESSMNIPDKDMVKDGLPSESVSSVSAGANAASGKGATDQPVTSEQGAYYSPTNCYDYYYPGYNGNFTQSDDKGFPNTPGGSYAGIQQDNSSLLYYVPSYGPYSTGFVGVDGKQAYTSSEYLQQPCSYGSEAFPCYTYDLAYAGNGSSSNKSGSVKSAGTSGSGRSNGFNVAKTNNNLSSKSSALPYNSRTQQPNSSRSIYQNQSLHPLSKLGTGFQSSGLMRGIQPAGNYSSFTSRNSRSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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