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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004150`

染色体: Chr08 坐标: 50680571-50683346 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004150`
名称	SmilChr08G004150
描述	uncharacterized protein At5g49945-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50680571 - 50683346 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998892`
GeneID	`130998892`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998892`
原始查询	`LOC130998892`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT4G24330; symbol=AT4G24330; hit=AT4G24330; species=arabidopsis; confidence=high
产物	AT4G24330; symbol=AT4G24330; hit=AT4G24330; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G24330` (AT4G24330) - identity=64.4; qcov=0.943; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0432400` - identity=64.5; qcov=0.752; evalue=1.72e-175; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0032469 (endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF07946 (CCDC47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998892

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057780305.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057780305.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057780305.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057780305.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057780305.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50680945`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B62
`Chr8:50680945`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B62
`Chr8:50681266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,C87
`Chr8:50681339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:50682203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr8:50682441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:50682713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:50682938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:50683199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,C11,C69,D11
`Chr8:50683226`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A19,A23,B112,B132,B15,B31,B63,C47,C7,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780305.1

509 aa

254

509

CCDC47

PF07946 CCDC47 181-498 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780305.1`	Pfam	`PF07946`	CCDC47	Family	181	498	9e-83	278.8	PAT complex subunit CCDC47

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924322.1
GACACATCAAACCTAATACTACTACTAATCAAGTTGAAAATATACACAAACAATGTTATTTGTAAAAAAATATAAATACAAATAATTGTTGATGTTGTTGCAGATCAAACACTCTCTCTCAACAATGGCGAATAGATCTTCCTTCTCCCTCCTCAACTCCCCCCTCTCTCTCCTCCTCCCGCGAGGCGACGCTTTCCTCTACCTCTTCGCCCTCCTCTCCATCTCCTCTCTCCTCCTCCACCACCTCACTCCCGCCGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998892
ATGTTGTTGCAGATCAAACACTCTCTCTCAACAATGGCGAATAGATCTTCCTTCTCCCTCCTCAACTCCCCCCTCTCTCTCCTCCTCCCGCGAGGCGACGCTTTCCTCTACCTCTTCGCCCTCCTCTCCATCTCCTCTCTCCTCCTCCACCACCTCACTCCCGCCGCCGCTCAACCCCACTTCGAGGGATTTGACGCCGATGAAGACGACGATTTCGCCCTCGGAGAACCTAAATCCGACGACTTCATCCGCCCCATCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780305.1
MLLQIKHSLSTMANRSSFSLLNSPLSLLLPRGDAFLYLFALLSISSLLLHHLTPAAAQPHFEGFDADEDDDFALGEPKSDDFIRPIRSSPPPISLSTSTPESHHGPPETDRSPPSDQNPKPASTSTSSFEYWDEDEFEGIPPTEAVTESAAAAAESDPVPSSGDSVKDPSSDVKVPMKITSFTVEIACVSFLIVFAINYFTGKKENENLALAWASKFATKDSIFEKNFSLLGVGETDDSPLLLQEGKNVFKFYASGRRYC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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