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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004154`

染色体: Chr08 坐标: 50709681-50715870 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004154`
名称	SmilChr08G004154
描述	ATP phosphoribosyltransferase 2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50709681 - 50715870 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998895`
GeneID	`130998895`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998895`
原始查询	`LOC130998895`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP phosphoribosyltransferase 2, chloroplastic-like
产物	ATP phosphoribosyltransferase 2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G09795` (ATP-PRT2) ATP phosphoribosyl transferase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837509] identity=74.87; qcov=0.972; evalue=0.0; confidence=high
Rice	`Os03g0134300` - identity=73.67; qcov=0.862; evalue=0.0; confidence=high
GO	GO:0000105 (L-histidine biosynthetic process); GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0003879 (ATP phosphoribosyltransferase activity); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	smil00340 (Histidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01634 (HisG); PF08029 (HisG_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998895

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780308.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057780308.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50710336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C75
`Chr8:50710785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:50710958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:50713206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:50715513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:50715561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780308.1

392 aa

196

392

HisG

HisG_C

PF01634 HisG 108-283 aa PF08029 HisG_C 291-373 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780308.1`	Pfam	`PF01634`	HisG	Family	108	283	9.6e-39	133.6	ATP phosphoribosyltransferase
`XP_057780308.1`	Pfam	`PF08029`	HisG_C	Domain	291	373	3.2e-11	43.9	HisG, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924325.1
GTGGCCATTTCCATAAGTATATTTGTGATTTGACTAAAATAATTATTCTTCAATCAAAGTGACTATGAAATTCCCAATTATAGCATGAATATTTAGAATTTCCCTAAAAATATGATGAAATATTCTAAAATTTATTCCTCCACATAATCAGCAATCACCATCAGAATCTACTCGTACGCCTCCCCGCACCCAATAATCATCTGCTGCGGCGGCGTTTAATCTTTCTCTTCTCTTCACAGTTCACACACACACACACAGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057780308.1_45349
ATGTCTGTGGCGCGGACGATTTTCCTGCAGTGCTCATCGATTCCGCATTTCCCGAATTCATCCTCTTCGCCCAACCCCGCGGCGGTCAAATTCACCGTCTCCTGCTGCTCGCTCGCGTCGCCGGCGGCCGTGGTGAATGGGAACGTCGAGAAGAAGTCTCACGACAGAAACGAAGTGCGCCTCGGCCTGCCGAGTAAAGGCCGGATGGCTACCGACACTCTCGACCTTCTCAAGGATTGTCAATTGTCGGTGAGGCAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780308.1
MSVARTIFLQCSSIPHFPNSSSSPNPAAVKFTVSCCSLASPAAVVNGNVEKKSHDRNEVRLGLPSKGRMATDTLDLLKDCQLSVRQVNPRQYVAEIPQISNLEVWFQRPKDVVRKLVSGDLDLGIVGLDTVMEFGQGNEDLILVHDSLDYGDCRLSLAIPKYGIFENINSLKELAEMPQWTPERPLRIATGFTYLGPKFMKDNGLSHVTFSTADGALEAAPAMGIADAIVDLVSSGTTLRENNLKEIQGGVILESQAVLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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