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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004159`

染色体: Chr08 坐标: 50886625-50888990 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004159`
名称	SmilChr08G004159
描述	40S ribosomal protein S12-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	50886625 - 50888990 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998899`
GeneID	`130998899`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998899`
原始查询	`LOC130998899`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S12-like
产物	40S ribosomal protein S12-like
Arabidopsis	`AT2G32060` (AT2G32060) Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817766] identity=71.3; qcov=0.853; evalue=7.1e-63; confidence=high
Rice	`Os07g0150200` - identity=83.7; qcov=0.944; evalue=2.62e-79; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01248 (Ribosomal_L7Ae)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998899

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780316.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780316.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057780316.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057780316.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780316.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:50887534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr8:50887590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr8:50887638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr8:50887675`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B42,B43
`Chr8:50887675`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr8:50887682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr8:50887728`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B86,C51
`Chr8:50887728`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B86,C51
`Chr8:50887730`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A3,B10,B112,B139,B28,B5,B61,B75,B9,C50,C58,C75,C77
`Chr8:50887739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B112,B139,B9,C77
`Chr8:50888703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr8:50888751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780316.1

143 aa

143

Ribosomal_L7Ae

PF01248 Ribosomal_L7Ae 29-122 aa

XP_057780317.1

143 aa

143

Ribosomal_L7Ae

PF01248 Ribosomal_L7Ae 29-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780316.1`	Pfam	`PF01248`	Ribosomal_L7Ae	Domain	29	122	2.2e-26	92.1	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family
`XP_057780317.1`	Pfam	`PF01248`	Ribosomal_L7Ae	Domain	29	122	2.2e-26	92.1	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924333.1
GGGACAAGGGGTATTCTAGTAATTTGGTAAAACTGAGGTTAGGGTTTAGGCCCATGTATAAATTATGTCACCCACCCACCGCTCCACCACTCTAGCGATTTCATCTGCAGCGCTGCCGTCACTCCGCCATCAGCAGGTTAGCAGCTTCGGAAGTCGGTATCTGGAAGAAAAATGTCGGGTGAGGATGCTGTTATCGCTGAGGCTCCAGCTCCTGTTCCAGCTCCAGCTCTTGGGGAACCTATGGATATCATGACTGCTTT...

XM_057924334.1
GGGACAAGGGGTATTCTAGTAATTTGGTAAAACTGAGGTTAGGGTTTAGGCCCATGTATAAATTATGTCACCCACCCACCGCTCCACCACTCTAGCGATTTCATCTGCAGCGCTGCCGTCACTCCGCCATCAGGTTAGCAGCTTCGGAAGTCGGTATCTGGAAGAAAAATGTCGGGTGAGGATGCTGTTATCGCTGAGGCTCCAGCTCCTGTTCCAGCTCCAGCTCTTGGGGAACCTATGGATATCATGACTGCTTTGCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130998899
ATGTCGGGTGAGGATGCTGTTATCGCTGAGGCTCCAGCTCCTGTTCCAGCTCCAGCTCTTGGGGAACCTATGGATATCATGACTGCTTTGCAGCTGGTTCTGAGGAAGTCGAGAGCCCACAGTGGTCTTTCTCGGGGGCTCCATGAAGCTGCCAAGGTCATCGAGAAGCATGCTGCTCAGCTTTGTGTCTTGGCAGAGGACTGCGACCAAGCAGATTATGTCAAATTGGTGAAAGCACTTTGTGCTGATCATAATGTTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780316.1
MSGEDAVIAEAPAPVPAPALGEPMDIMTALQLVLRKSRAHSGLSRGLHEAAKVIEKHAAQLCVLAEDCDQADYVKLVKALCADHNVSLITVPSAKTLGEWAGLCKIDSEGKARKVVGCACVVVKDYGEESEGLHIVQEYVKSH

XP_057780317.1
MSGEDAVIAEAPAPVPAPALGEPMDIMTALQLVLRKSRAHSGLSRGLHEAAKVIEKHAAQLCVLAEDCDQADYVKLVKALCADHNVSLITVPSAKTLGEWAGLCKIDSEGKARKVVGCACVVVKDYGEESEGLHIVQEYVKSH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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