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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004037`

染色体: Chr01 坐标: 58779106-58784047 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004037`
名称	SmilChr01G004037
描述	RNA demethylase ALKBH10B-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58779106 - 58784047 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998901`
GeneID	`130998901`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998901`
原始查询	`LOC130998901`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA demethylase ALKBH10B-like
产物	RNA demethylase ALKBH10B-like
Arabidopsis	`AT4G02940` (AT4G02940) oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828132] identity=52.8; qcov=0.988; evalue=1.65e-163; confidence=high
Rice	`Os10g0116900` (OSJNBa0023I19.11) - identity=31.1; qcov=0.996; evalue=4.83e-64; confidence=low
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0006402 (mRNA catabolic process); GO:0032451 (demethylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF27981 (ALKBH10B_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998901

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780323.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780323.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780323.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780323.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780323.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58779513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B140,B84,B94,C47
`Chr1:58779544`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B14,B96
`Chr1:58779544`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B14,B96
`Chr1:58779548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:58779700`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B39
`Chr1:58779700`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B39
`Chr1:58779826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:58780841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr1:58781103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:58783205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B5
`Chr1:58783249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B105,B20,B40,C84
`Chr1:58783349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780323.1

517 aa

258

517

ALKBH10B_N

PF27981 ALKBH10B_N 35-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780323.1`	Pfam	`PF27981`	ALKBH10B_N	Domain	35	113	3.8e-38	130.5	RNA demethylase ALKBH10B N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924340.1
AGTATGATATTATTTCTTGTTTTATCTTACCTATATATATTGAGATATGAATGAGAAGCTTAAGTAAAATAAAGTACATAATTAATTTCCCAAATTTGGCTTAGATGCCCCAGCAAACCACATTAATTCCACCTAAACCCCGAGATCCTAACCCTCGCTTTCGTCACCACCTTTTTCTCGTGTTTTTCCGCTCTCCACACTAACCAATTTCTCTCACATTTTCAGCTTCATTTTCAACAATATAACTCCGAACAAATCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998901
ATGGCGCCGGCGGCCGGCGTATTGTTACAGGGCGACCGGGTCCCGGCAAAGCCGATGGTGGTGCCGCAGCTTCGGTCGGCGCCAGTGCCGGAGGTTGTCGCCAAGGACGCTATCATCGCGTGGTTCCGCGGCGAATTCGCGGCGGCGAACGCCATCATCGACGCACTCTGCAGCCACCTGCAGGAGCTGGAGAGCATCGGCAGAGGGGCGGATTACGGATCGGTCTTTGCGGCGATTCATCACCGGCGGCTGAATTGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780323.1
MAPAAGVLLQGDRVPAKPMVVPQLRSAPVPEVVAKDAIIAWFRGEFAAANAIIDALCSHLQELESIGRGADYGSVFAAIHHRRLNWVPILQMQKYYPIVDVMAELEKVAEKKREVVVVGAGGGCTSAFKEEYAEKEKEKNVDGSDNAGGETVAEDGGETMVVDSPESDYTDSGSQELQILCSNHEECEARQAQIKMTKGFVAKEPVKGQMVNVVRGLKLYEDIFTGGELSKLNDFVNELRLAGRDGELSGDTYILYNQQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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