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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004188`

染色体: Chr08 坐标: 51299379-51300605 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004188`
名称	SmilChr08G004188
描述	pathogenesis-related genes transcriptional activator PTI6-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51299379 - 51300605 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998922`
GeneID	`130998922`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998922`
原始查询	`LOC130998922`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pathogenesis-related genes transcriptional activator PTI6-like
产物	pathogenesis-related genes transcriptional activator PTI6-like
Arabidopsis	`AT4G27950` (CRF4) cytokinin response factor 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828908] identity=35.4; qcov=1.1; evalue=1.38e-44; confidence=medium
Rice	`Os01g0224100` (OsERF#053) - identity=50; qcov=0.545; evalue=6.09e-31; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998922

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780338.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780338.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780338.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780338.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780338.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51299507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr8:51299598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr8:51299965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr8:51299970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:51300181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr8:51300256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B4,B74,C11,C49,C69
`Chr8:51300284`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	191	A10,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B111,B112,B113,B114,B118,B12,B121,B122,B124,B125,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B139,B140,B15,B17,B19,B21,B22,B23,B25,B26,B27,B29,B3,B30,B31,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B61,B64,B66,B68,B69,B72,B73,B74,B75,B76,B79,B8,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B98,B99,C10,C12,C14,C16,C17,C19,C2,C20,C21,C22,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C36,C39,C4,C40,C41,C43,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C58,C59,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C79,C82,C83,C84,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780338.1

275 aa

138

275

AP2

PF00847 AP2 114-163 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780338.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	114	163	6.6e-16	59.1	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924355.1
CTCTCTCTCTCTGTTTTCTTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCTTATAAATTAGAGAATTTGGGAGAATCTCTCACTATCAGTATCAGTTAGAAAATTACTGCTTTTACTATTGATTCTTAATCTTCATCAGTTACAACAACGCCTCTTTCACTCCCCCTCTCTCTCTCTCTTCAATTTTCCTGTTTTTCACCTTTTTCTTCCACAAATTCTTCATTTTTCTCACTCCATTTTTTTGCTGGTTTAGTTTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998922
ATGAGTTCAAGACATTTACCCATCAAATACTCAGAGCAGAAAATCGTCACCACAAAATTCCTCCCATGCAGCGGCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCGCCCTACCACCCGCCGCGCGTCGTGAGGATCTTTGTTACCGACGGCGACGCCACCGACTCCTCCGGCGACGAGTGCGATCACAGCTGCGGGCGCCAGGTCCGCCGCCACGTCAACGAGATTAGGCTAGAGAGAGAAAACACCGCCGCCGCCGTCAAAAAAGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780338.1
MSSRHLPIKYSEQKIVTTKFLPCSGAAAAATAPYHPPRVVRIFVTDGDATDSSGDECDHSCGRQVRRHVNEIRLERENTAAAVKKAATEGARKKKKRPAPARPGAGNEEGKGKKFRGVRQRPWGKWSAEIRDPARRARVWLGTFDTAEEAAMAYDKASIEIRGPDAVTNFLKPPQREAEETTVAEECSRKEEGYGSPISVLGFLGFRGNDLMNDKFEDEVLMDESLPLDRSFLDDFDSLPLICDEISVPKLDIDDFASLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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