当前解析结果
SmilChr08G004198| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004198 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004198 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G004198 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 51370683 - 51371426 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998933 |
|---|---|
| GeneID | 130998933 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998933 |
| 原始查询 | LOC130998933 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | transmembrane protein, putative (DUF1191) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828157]; symbol=AT4G01140; hit=AT4G01140; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | transmembrane protein, putative (DUF1191) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828157]; symbol=AT4G01140; hit=AT4G01140; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT4G01140 (AT4G01140)transmembrane protein, putative (DUF1191) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828157] identity=30.6; qcov=1.05; evalue=2.63e-10; confidence=low |
| Rice | Os11g0118600- identity=29.7; qcov=0.993; evalue=3.32e-08; confidence=low |
| GO | GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF06697 (DUF1191) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998933 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057780351.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057780351.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780351.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780351.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057780351.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:51370988 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr8:51371052 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B124,D10 |
Chr8:51371066 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C83 |
Chr8:51371187 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B101 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057780351.1PF06697
DUF1191 5-66 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057780351.1 |
Pfam | PF06697 |
DUF1191 | Family | 5 | 66 | 2.4e-07 | 31.3 | Protein of unknown function (DUF1191) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。