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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004196`

染色体: Chr08 坐标: 51366041-51367970 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004196`
名称	SmilChr08G004196
描述	GDSL esterase/lipase At4g01130-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51366041 - 51367970 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998935`
GeneID	`130998935`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998935`
原始查询	`LOC130998935`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase At4g01130-like
产物	GDSL esterase/lipase At4g01130-like
Arabidopsis	`AT4G01130` (AT4G01130) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828207] identity=57; qcov=0.956; evalue=2.1e-154; confidence=high
Rice	`Os06g0160200` (OsGELP80) - identity=58.3; qcov=0.918; evalue=5.48e-158; confidence=high
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998935

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057780355.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057780355.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780355.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780355.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780355.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51366145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:51366187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:51366245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:51366532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr8:51367152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B69,B73,C23
`Chr8:51367156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B5,B54,C73,C9
`Chr8:51367194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:51367320`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	39	A11,A2,A25,A3,A4,A6,A8,B110,B117,B123,B130,B18,B19,B22,B3,B30,B33,B37,B5,B53,B62,B65,B70,B75,B9,B92,B97,C16,C32,C37,C40,C42,C45,C5,C50,C56,C6,C68,C9
`Chr8:51367358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B27,B69,C78,D1
`Chr8:51367430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:51367656`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A19,B16,B2,B78,C82,D11
`Chr8:51367692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780355.1

389 aa

194

389

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 41-367 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780355.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	41	367	4e-46	158.5	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924372.1
TGAGCAAACAAAGAAATGGACCAACAAACTCCACATGAAAAACATGCAATTATTTTCAGACAATTCTTGGTTTCTTGGATAGTTTTGATGACAATGTCAGCTTCCATGATCAATGCAAAATGCTCATTCGAGGCCATTTTCGCCTTCGGGGACTCGAACACCGATACAGGAGGTTTTTTTGCTGCTTTCCCATCTCAGCCATCTCCTAATGGCATGACCTATTTCAGTAGGCCGACTGGCCGACCTTCTGATGGGAGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998935
ATGGACCAACAAACTCCACATGAAAAACATGCAATTATTTTCAGACAATTCTTGGTTTCTTGGATAGTTTTGATGACAATGTCAGCTTCCATGATCAATGCAAAATGCTCATTCGAGGCCATTTTCGCCTTCGGGGACTCGAACACCGATACAGGAGGTTTTTTTGCTGCTTTCCCATCTCAGCCATCTCCTAATGGCATGACCTATTTCAGTAGGCCGACTGGCCGACCTTCTGATGGGAGGCTGTACATCGATTTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780355.1
MDQQTPHEKHAIIFRQFLVSWIVLMTMSASMINAKCSFEAIFAFGDSNTDTGGFFAAFPSQPSPNGMTYFSRPTGRPSDGRLYIDFLTQALGLPFLSPYLQSVGSDFRHGVNFATSASTVLQPNTSLFVSGVSPFYLAVQINQMKHFKARVEEFKSQGQTNLPQPDIFGKALYVIYIGQNDFTGFAGSAGAGGVKQVEPQIVSHITSAVKDLYRMGGRTFMVLNLAPVGCFPAYLEHLPHAGSDIDQSGCMASYNNAVKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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