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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004215`

染色体: Chr08 坐标: 51521599-51524293 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004215`
名称	SmilChr08G004215
描述	uncharacterized SmilChr08G004215
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51521599 - 51524293 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998946`
GeneID	`130998946`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998946`
原始查询	`LOC130998946`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	KMK0024M20.35; symbol=KMK0024M20.35; hit=Os06g0158600; species=rice; confidence=high
产物	KMK0024M20.35; symbol=KMK0024M20.35; hit=Os06g0158600; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G46230` (AT2G46230) PIN domain-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819231] identity=82.2; qcov=0.995; evalue=1.13e-121; confidence=high
Rice	`Os06g0158600` (KMK0024M20.35) - identity=85.4; qcov=1; evalue=5.81e-128; confidence=high
GO	GO:0005730 (nucleolus); GO:0032040 (small-subunit processome)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04900 (Fcf1); PF18477 (PIN_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998946

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780369.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057780369.1`
3	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.60000	`XP_057780369.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057780370.1`
5	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.40000	`XP_057780370.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51521967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:51521974`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A19,A20
`Chr8:51521974`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A19,A20
`Chr8:51521993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,B78
`Chr8:51522510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:51522527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr8:51523112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr8:51523617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:51523627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C10,C33,C62
`Chr8:51523800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B76,B91
`Chr8:51523839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B93,C43
`Chr8:51523844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B76,B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780369.1

215 aa

108

215

PIN_9

Fcf1

PF18477 PIN_9 67-177 aa PF04900 Fcf1 90-186 aa

XP_057780370.1

198 aa

198

PIN_9

Fcf1

PF18477 PIN_9 67-177 aa PF04900 Fcf1 90-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780369.1`	Pfam	`PF18477`	PIN_9	Domain	67	177	2.3e-06	28.5	PIN like domain
`XP_057780369.1`	Pfam	`PF04900`	Fcf1	Domain	90	186	2.4e-36	124.7	Fcf1
`XP_057780370.1`	Pfam	`PF18477`	PIN_9	Domain	67	177	1.8e-06	28.9	PIN like domain
`XP_057780370.1`	Pfam	`PF04900`	Fcf1	Domain	90	186	2e-36	125.0	Fcf1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924387.1
AAATATATTGAAAATTAATAATAATATACAAATTAGAATTACAAACCCTAGTTTCTACTTTTTCTCCAATTCCCTCGGTCCCTCCCTCTCCAGGTCGCCCACGCCTCCCTCTCAATCCAGTGCGCCGGCGAAGGGAAGTTACAGCCTTCGACACTCTCGCTAGATAGCCGAATTTAGGATTTTCAATTTAGGGGTTTAGGGTTTACGTTTCTCAGAATAACTCTTCAAGTCTGAATCAATACGATAACAGATTCAACCTC...

XM_057924386.1
AAATATATTGAAAATTAATAATAATATACAAATTAGAATTACAAACCCTAGTTTCTACTTTTTCTCCAATTCCCTCGGTCCCTCCCTCTCCAGGTCGCCCACGCCTCCCTCTCAATCCAGTGCGCCGGCGAAGGGAAGTTACAGCCTTCGACACTCTCGCTAGATAGCCGAATTTAGGATTTTCAATTTAGGGGTTTAGGGTTTACGTTTCTCAGAATAACTCTTCAAGTCTGAATCAATACGATAACAGATTCAACCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130998946
ATGGGGAAAGCGAAGAAAACTCCTAAATTTGCTGTTATGAAGAAAATCGTCACCCATAAAGCAATTAAACAGTACAAGGAGGATGTCTTGAACCCTAACAGGAAAGACTTGACCAAGGAGAAACTCCCCCGCAATGTGCCGCAAGTTTCATCAGCGCTTTACTTCAAGCACAATACTGCTTTAGGGCCGCCATACCGAGTATTGGTGGATACTAACTTCATTAATTTCTCCATCCAAAATAAATTAGATTTGGAGAAAGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780369.1
MGKAKKTPKFAVMKKIVTHKAIKQYKEDVLNPNRKDLTKEKLPRNVPQVSSALYFKHNTALGPPYRVLVDTNFINFSIQNKLDLEKAMMDCLYAKCTPCITDCVMAELEKLGQKYRVALRIAKDPRFERLPCIHKGTYADDCLVDRVTQHKCYIVATCDRDLKRRIRKIPGVPIMYITKHQYSIERLPEATIGGGRINHSLSTCFLYSSLKFRIS

XP_057780370.1
MGKAKKTPKFAVMKKIVTHKAIKQYKEDVLNPNRKDLTKEKLPRNVPQVSSALYFKHNTALGPPYRVLVDTNFINFSIQNKLDLEKAMMDCLYAKCTPCITDCVMAELEKLGQKYRVALRIAKDPRFERLPCIHKGTYADDCLVDRVTQHKCYIVATCDRDLKRRIRKIPGVPIMYITKHQYSIERLPEATIGGAPRV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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