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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004225`

染色体: Chr08 坐标: 51652169-51656743 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004225`
名称	SmilChr08G004225
描述	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 59 kDa protein-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51652169 - 51656743 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998955`
GeneID	`130998955`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998955`
原始查询	`LOC130998955`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 59 kDa protein-like
产物	U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 59 kDa protein-like
Arabidopsis	`AT2G46200` (AT2G46200) U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819227] identity=50.4; qcov=0.998; evalue=3.71e-131; confidence=high
Rice	`Os01g0226500` (P0492F05.33-1) - identity=53; qcov=0.966; evalue=9.41e-122; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF16021 (PDCD7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998955

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780381.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057780381.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057780381.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780381.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780381.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51653182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B4
`Chr8:51653249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr8:51653753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,C32,C68
`Chr8:51653823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,C22,C84
`Chr8:51653894`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr8:51653894`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr8:51654083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A15,B123,B127,B23,B32,B67,C26,C36,C48,C49
`Chr8:51654111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:51655142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,C5
`Chr8:51655376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr8:51655449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B22
`Chr8:51655510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B33,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780381.1

414 aa

207

414

PDCD7

PF16021 PDCD7 345-410 aa

XP_057780382.1

414 aa

207

414

PDCD7

PF16021 PDCD7 345-410 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780381.1`	Pfam	`PF16021`	PDCD7	Family	345	410	3.1e-18	66.8	Programmed cell death protein 7
`XP_057780382.1`	Pfam	`PF16021`	PDCD7	Family	345	410	3.1e-18	66.8	Programmed cell death protein 7

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924398.1
GAACTCCGGCCACCGGCGACCTCCGCAACCCCACCCCCACCCCCACACCACCAGTTCGCCGCGCTGCCGCGTAGAGCACGCTCACCTCCCAGTGCTCCCACCGCCGCGTGGAGCGCAGCTCCAGGCTCAAATCCCAGAATTTTGCGGTTTGCATTATCTGCAGGTAGGCATAAAGCTTAATGTCTCTGTCAAATGGCGAAACCAGTGCTCCGGTCTCTCCTCAGCGTATCTTCACTTCTCCACCGTTCGATCTCTTTCAG...

XM_057924399.1
CACCGGCGACCTCCGCAACCCCACCCCCACCCCCACACCACCAGTTCGCCGCGCTGCCGCGTAGAGCACGCTCACCTCCCAGTGCTCCCACCGCCGCGTGGAGCGCAGCTCCAGGCTCAAATCCCAGAATTTTGCGGTTTGCATTATGTAGGCATAAAGCTTAATGTCTCTGTCAAATGGCGAAACCAGTGCTCCGGTCTCTCCTCAGCGTATCTTCACTTCTCCACCGTTCGATCTCTTTCAGATCGGGGTTCAAGTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130998955
ATGAATCCGATGGGGATGCCTCCATTTAACCAGGCCCTACCGCCGTGGGGCCCGCCACCGCCGCCGCAGCTGCCGCATATGCCCCCTCCATCTGCTTCGTTCTGGACTTCGGCAAACGTGAGCAGCCGCCTCAAAGAACTTCACGACACTTTAAACCTCGCCAAAGCCATGCAGAAAGAGTTGGAGATGTTGATTCGGATGAAAGAAGGGGATGGGAGTAGTGAAGGTGAAGATTTTGGGCGTGGCAACGTGTCGATTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780381.1
MNPMGMPPFNQALPPWGPPPPPQLPHMPPPSASFWTSANVSSRLKELHDTLNLAKAMQKELEMLIRMKEGDGSSEGEDFGRGNVSISRFSRFMKDNGIGVEFQETMSLSTANAVMSKLRFLLEPFRVVADENSPWEEKSAVKRLADKMEKYKRNKLWRKRKRRRVAENLAKEHEQFDKIDKEADEWRKMEIAKDIAQQKVEKMKEIAKLKAKEEKKRLESELELVLIVEKLQELRSLRIQKMKKQGHFLPEEDDKFLERV...

XP_057780382.1
MNPMGMPPFNQALPPWGPPPPPQLPHMPPPSASFWTSANVSSRLKELHDTLNLAKAMQKELEMLIRMKEGDGSSEGEDFGRGNVSISRFSRFMKDNGIGVEFQETMSLSTANAVMSKLRFLLEPFRVVADENSPWEEKSAVKRLADKMEKYKRNKLWRKRKRRRVAENLAKEHEQFDKIDKEADEWRKMEIAKDIAQQKVEKMKEIAKLKAKEEKKRLESELELVLIVEKLQELRSLRIQKMKKQGHFLPEEDDKFLERV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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