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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004235`

染色体: Chr08 坐标: 51767118-51768116 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004235`
名称	SmilChr08G004235
描述	RING-H2 finger protein ATL67
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51767118 - 51768116 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998964`
GeneID	`130998964`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998964`
原始查询	`LOC130998964`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL67
产物	RING-H2 finger protein ATL67
Arabidopsis	`AT3G61550` (AT3G61550) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825328] identity=57.8; qcov=1.11; evalue=8.52e-71; confidence=high
Rice	`Os01g0736600` - identity=53.5; qcov=0.963; evalue=4.03e-48; confidence=medium
GO	GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0016740 (transferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13639 (zf-RING_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998964

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780389.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057780389.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057780389.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780389.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780389.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51767350`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A2
`Chr8:51767350`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A2
`Chr8:51767595`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B28
`Chr8:51767595`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B28
`Chr8:51767721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B101,B82,D5
`Chr8:51767739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B101,B82,D5
`Chr8:51767869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,C18,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780389.1

190 aa

190

zf-RING_11

zf-C3HC4

zf-RING_2

PF17123 zf-RING_11 120-148 aa PF00097 zf-C3HC4 120-161 aa PF13639 zf-RING_2 120-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780389.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	120	148	1e-08	35.4	RING-like zinc finger
`XP_057780389.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	120	161	4.4e-05	24.0	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057780389.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	120	162	1.6e-12	48.2	Ring finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924406.1
AAGAAGTAAATTAATCAAAAAAAAAAAAATCTGAGAAGAGCATCGCCATCATTCATCTTCTATATTGGTCATTAAATGAGTTGCTCTGTGTATTAAATGCTGCAGCTCAGCACCTCCACCCACCCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAATTTCCCCCTCATTCAAATGGCCATGCCCACCACCCCCACCCTCCGCCTCTCCCAATGTCCACCGCCCCCCCGCCGCCCCTAGCCGCCGCCACGAAACCCTCCTTCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998964
ATGTCCACCGCCCCCCCGCCGCCCCTAGCCGCCGCCACGAAACCCTCCTTCTCCCAGAACCTCACCTCCATCGGCCTCGGCTACGCCATCGCCATCGCCCTCGGCTTCCTCGTCCTCTTCTCCACCATCCTCCTCTCCTCCTACATATGCTGCCGCTCCATCGCCGCCCGCCGCCGCCGCCGCAACCCCAGCCGCTCCGCCGAGAACAGCGTCTACCTCCCGCGGATCATCTTCGTCGCCGAGGACGACGACAGCGAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780389.1
MSTAPPPPLAAATKPSFSQNLTSIGLGYAIAIALGFLVLFSTILLSSYICCRSIAARRRRRNPSRSAENSVYLPRIIFVAEDDDSEGQNVVAGLDQAVINSYPKFVFTKRSGAAAGDGVCSICLSDYRESEMLRMLPDCRHCFHVMCVDAWLKLNASCPVCRNSPLPTPLSTPLQEVVPLSQYSDGRRRG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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