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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004246`

染色体: Chr08 坐标: 51907094-51908754 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004246`
名称	SmilChr08G004246
描述	WRKY transcription factor 22
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	51907094 - 51908754 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998975`
GeneID	`130998975`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998975`
原始查询	`LOC130998975`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WRKY transcription factor 22
产物	WRKY transcription factor 22
Arabidopsis	`AT4G01250` (WRKY22) WRKY family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827896] identity=53; qcov=1.03; evalue=9.11e-88; confidence=high
Rice	`Os02g0265200` (OsWRKY39) - identity=77.5; qcov=0.319; evalue=8.76e-49; confidence=low
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998975

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780410.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780410.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780410.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780410.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780410.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:51907578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B3,B5,C5,C56
`Chr8:51907730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr8:51907754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C9
`Chr8:51907786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr8:51908176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B7,C48,C78
`Chr8:51908242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr8:51908395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780410.1

307 aa

154

307

WRKY

PF03106 WRKY 144-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780410.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	144	201	9e-26	90.6	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924427.1
AAGCGAGAAGCGAGAAAACTTCCGTGAGCCTTTGAGAATGCCCATCAACCCCCTCTCTCTCTCTCTCGACTTTTTTAGTGAGAGAAAGACAGAGGCATCCTCAGCCGCGCATCCCCTCTCTCTCTCTCTATAAATAAATTTGCTTTCTTTTCCACTCATTTCATTTACATATCCCACCACTTCTCTCTCTCTAAAAAAGTCAGCGCCTCCTTTTGTCCCTGCTTCATAACTCACAAGAGCAAAGGAATGGAAGATGACTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998975
ATGGAAGATGACTGGGATCTCCACGCCGTCGTCAGAGGCTGCGCCGCCGCCACGAGCAACACCAGATCCCTTCAAGCTCTCTACGGTCATCAGCAGGCTTGCAGCAGCTTCTCCGCCTCCAGCTTCCAAGATCTGCTCGAGCCCAGACGAAACGGCGGCGTTCGAGAAGGCCTGATTGATCTCTACAATTACAAACCCCTTTTCCCCAACTCGGAAATCCCATTCTCTTTGCCGGTTTCAACCATCTCCGCCCTCGTAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780410.1
MEDDWDLHAVVRGCAAATSNTRSLQALYGHQQACSSFSASSFQDLLEPRRNGGVREGLIDLYNYKPLFPNSEIPFSLPVSTISALVGSQDPPPPQTQLRPKHHSFSVSNASKTSASHSPTPRSKRRKTHTKKVCHVAAENLSSDVWSWRKYGQKPIKGSPYPRGYYRCSTSKGCMARKQVERNRSDPGMFIVTYTAEHNHPMPTHRNSLAGSTRNKPADPIGTSFSPEVSPATSLSPAAEKLESSREEELAEDDDDGVFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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