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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001079`

染色体: Chr01 坐标: 22226648-22231538 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001079`
名称	SmilChr01G001079
描述	uncharacterized SmilChr01G001079
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	22226648 - 22231538 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998985`
GeneID	`130998985`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998985`
原始查询	`LOC130998985`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os09g0268600` - identity=38.1; qcov=0.303; evalue=8.35e-14; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998985

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780458.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057780458.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780458.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780458.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780458.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:22227401`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	61	A10,A16,A18,A21,A22,A23,A3,A4,B102,B110,B115,B12,B135,B136,B137,B139,B140,B19,B21,B22,B34,B35,B36,B39,B4,B41,B47,B48,B5,B51,B59,B6,B67,B76,B81,B82,B85,B87,B92,C10,C14,C18,C20,C29,C3,C32,C39,C42,C45,C56,C59,C6,C60,C63,C65,C67,C71,C74,C83,D1,D9
`Chr1:22227420`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A10,B119,B136,B137,B34,B35,B36,B4,B81,C17,C32,C42,C71
`Chr1:22227452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:22227456`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr1:22227456`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr1:22231118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,D6
`Chr1:22231131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B101,C12,C51
`Chr1:22231135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B136,B34
`Chr1:22231137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C19
`Chr1:22231140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr1:22231143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C80,C9
`Chr1:22231154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B120,B139,B37,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780458.1

346 aa

173

346

SWIM

PF04434 SWIM 11-41 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780458.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	11	41	7.7e-08	32.4	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924475.1
ATGTTTAGTGTTGAGGATGATCATGCATTCTACATTGTCGATCTCGAGAATCGGACTTGTAGTTGTGCTCAGTTCGACTTGGATGACATTCCGTGTCGTCATGCTTGTGCCGCTATTAGGCGTGCAGGACTGCAAGTCACAGATTTTGTTGGAAGATATTTCAAACAATCTGTGCTGTTGGCCACATATATGGAGCGTATTGTTCCCGTTCCACATCCTACGTATTGGAATGTGCCCGATGAGATATCAGCCTATGTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998985
ATGTTTAGTGTTGAGGATGATCATGCATTCTACATTGTCGATCTCGAGAATCGGACTTGTAGTTGTGCTCAGTTCGACTTGGATGACATTCCGTGTCGTCATGCTTGTGCCGCTATTAGGCGTGCAGGACTGCAAGTCACAGATTTTGTTGGAAGATATTTCAAACAATCTGTGCTGTTGGCCACATATATGGAGCGTATTGTTCCCGTTCCACATCCTACGTATTGGAATGTGCCCGATGAGATATCAGCCTATGTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780458.1
MFSVEDDHAFYIVDLENRTCSCAQFDLDDIPCRHACAAIRRAGLQVTDFVGRYFKQSVLLATYMERIVPVPHPTYWNVPDEISAYVVKPPDITVHAGRPKLSRARSAVEGPPNSGLPNSRPQLSAISFKPLSISLFILLILSSKIRKTNAAHLFLFLTTHSHTIHHLSLILTRSPLPSALSFHHVSGSLFSLQDLPPPPALTSARIAGSDASLTHRLLLLASTSISLALSAAGPRRSSHHHRGVPPSPGRRLLPHPRGRS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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