当前解析结果
SmilChr08G004283| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004283 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004283 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G004283 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 52459304 - 52477785 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130999016 |
|---|---|
| GeneID | 130999016 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130999016 |
| 原始查询 | LOC130999016 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130999016 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057780462.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057780462.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780462.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780462.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057780462.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:52459595 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B69,C22 |
Chr8:52459802 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B134,B74,C64 |
Chr8:52476023 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 11 | B11,B115,B138,B17,B20,B28,B64,B81,B99,C1,C13 |
Chr8:52476033 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A24,B15,B42 |
Chr8:52476038 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 93 | A1,A11,A16,A19,A23,A4,B102,B104,B105,B11,B114,B117,B12,B121,B122,B126,B127,B128,B129,B139,B15,B17,B21,B23,B25,B27,B33,B34,B37,B38,B4,B40,B41,B45,B46,B5,B57,B58,B63,B65,B66,B67,B68,B71,B73,B74,B75,B8,B85,B86,B99,C1,C10,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C20,C22,C26,C31,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C4,C41,C46,C47,C50,C53,C61,C63,C68,C7,C71,C74,C75,C76,C8,C80,C82,C84,D2,D3,D5,D6,D7 |
Chr8:52476076 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B66,B8 |
Chr8:52476100 |
ACC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 10 | A13,B100,B104,B3,B4,B85,C12,C15,C21,C35 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。