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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004047`

染色体: Chr01 坐标: 58902343-58908090 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004047`
名称	SmilChr01G004047
描述	uncharacterized SmilChr01G004047
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58902343 - 58908090 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999022`
GeneID	`130999022`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999022`
原始查询	`LOC130999022`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ELKS/Rab6-interacting/CAST family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828150]; symbol=AT4G02880; hit=AT4G02880; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	ELKS/Rab6-interacting/CAST family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828150]; symbol=AT4G02880; hit=AT4G02880; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G02880` (AT4G02880) ELKS/Rab6-interacting/CAST family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828150] identity=51.5; qcov=0.546; evalue=4.6e-84; confidence=medium
Rice	`Os10g0315400` (SIP28) - identity=49; qcov=0.328; evalue=8.25e-49; confidence=low
GO	GO:0043130 (ubiquitin binding)
KEGG	-
Pfam	PF31072 (CUE_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999022

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780480.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057780480.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057780480.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780480.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780480.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58903196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,C62,C86
`Chr1:58903670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C85
`Chr1:58903712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C44
`Chr1:58903877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr1:58903981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,C39,C8
`Chr1:58904057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:58904185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:58906334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B126,B57,C43
`Chr1:58907221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:58907814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780480.1

597 aa

298

597

CUE_1

PF31072 CUE_1 1-45 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780480.1`	Pfam	`PF31072`	CUE_1	Domain	1	45	9e-25	87.4	CUE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924497.1
TCACGCGAAATGACTAAAATATCCAATTTCTTAGCGCCATAACTTCTCCCTCATGCCAAGTTGCCGACTCTAAAATCAGCTTACCCAATCCTCCTCTTCATCATGTTGTACCGTCAAGTTAAAACTATGACTATTAAGATCGCAGTCAACTTATACTAAATGTACAATCATCTCAAGCCCAAAATTGAAATTGATAAAATAAATCGAAAAACCATTTTCAATGATGATCACTACGTACAAGTTTCCATCCTGTTTCGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999022
ATGGGATTCAATAAAGTTTACAAGTCATTGCAGGAAATTTTCCCACAGATTGATGCTCGAGCTCTTAGAGCTGTAGCTATTGAGCATAGCAAGGATGCTGATGCAGCTGTTGAAGCTGTGCTTGTGGAGATTATACCTTTCTTTTCTGAACGGTCTAGACCAAGTACCCCTTCGACTGGGAGCATTGCTGTTGGAGAACCATCAGGAGGTGCTATTGCCACAGTTCAAACTGCGGATTGCACATCTATGAATGGTGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780480.1
MGFNKVYKSLQEIFPQIDARALRAVAIEHSKDADAAVEAVLVEIIPFFSERSRPSTPSTGSIAVGEPSGGAIATVQTADCTSMNGAAGSTNAQNGYIANVGYQQSFRDVNDGHMENLSDTNVGHREGEGVLAELTLSGSIHDNNIQLKTDIFSHDEVVHLTNKDGANALQIEASVEPKTDNTTSDSSIKLASDDACHTVGTSQGKDAGSIQDVNILGDGSNSRCLETEFDKPTNNECDQGKPYGDDKICAIGPVSFIVHD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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