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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004297`

染色体: Chr08 坐标: 52659956-52663849 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G004297`
名称	SmilChr08G004297
描述	sphingoid long-chain bases kinase 2, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	52659956 - 52663849 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999026`
GeneID	`130999026`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130999026`
原始查询	`LOC130999026`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sphingoid long-chain bases kinase 2, mitochondrial
产物	sphingoid long-chain bases kinase 2%2C mitochondrial
拟南芥	`AT2G46090` (LCBK2) Diacylglycerol kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819217] identity=70.75; qcov=0.992; evalue=0.0; confidence=high
水稻	`Os03g0125400` - identity=65.0; qcov=0.946; evalue=3.32e-164; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0008654 (phospholipid biosynthetic process); GO:0016301 (kinase activity); GO:0016310 (phosphorylation); GO:0042721 (TIM22 mitochondrial import inner membrane insertion complex); GO:0045039 (protein insertion into mitochondrial inner membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00781 (DAGK_cat); PF19279 (YegS_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999026

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞质	1.00000	`SmilChr08G004297.1`
2	细胞质基质	0.40000	`SmilChr08G004297.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:52660291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr8:52661962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C59,D3
`Chr8:52662402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:52662932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B115,B117,B70
`Chr8:52663357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G004297.1

来源蛋白: XP_057780482.1

355 aa

178

355

DAGK_cat

YegS_C

PF00781 DAGK_cat 46-181 aa PF19279 YegS_C 205-354 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`SmilChr08G004297.1` XP_057780482.1	Pfam	`PF00781`	DAGK_cat	Family	46	181	3e-28	98.6	Diacylglycerol kinase catalytic domain
`SmilChr08G004297.1` XP_057780482.1	Pfam	`PF19279`	YegS_C	Domain	205	354	7.3e-26	91.5	YegS C-terminal NAD kinase beta sandwich-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924499.1
TAATTATGAGACGACAATTTCCTTTTGACAGTAAAGGCCGATGATTATTAAGATAACGGCGGCTGGCCGCCATTAAACAACGGAACTAAAAGCTCTAATTACGCAGAGCTTAGACTGCAGATTAAGCCTTAATCACCCAATCCACATATTTGCCTTCAAAATCTTCTCGCTTAATTACTATCCGAAGTTTATATTGGCTATACACATTTATACATGCGATAGCAATTATGATTGCGTGTGCAGTGGCGATCATCCCAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

SmilChr08G004297.1 (XP_057780482.1)
ATGATTGCGTGTGCAGTGGCGATCATCCCAATGTCTAGAACCTCGTTTATCCGAGCAGAGCAACCGCTCGCTCCAGATCTCGCCGCCGACAATACAACCGGCAGAGGCGGCGGCGCCACCTCTCGCCGCCGAGACATCGTCTTCATCGTTAATCCTCGAGGAGCTAATGGAAGGACCGGCAAGGAGTGGAAGAAGCTGTTGCCTTACCTGAGGTCTCGCCTTGATTCTGATTGCAATATATGCGAATCTTTGACTTCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

SmilChr08G004297.1 (XP_057780482.1)
MIACAVAIIPMSRTSFIRAEQPLAPDLAADNTTGRGGGATSRRRDIVFIVNPRGANGRTGKEWKKLLPYLRSRLDSDCNICESLTSGPCHAIDITREAIREGADAVIAVGGDGTLHEVVNGFFWGGKPVSDHDQSGHTTALGLIPLGTGSDFARTFGWKNDPHEAIERISRGIRSRIDVGVIAGESAELHYFINVADVHLSAKAGYYASRYKKFGNFCYVIGALQAFFGHHNQDLRIKVDDGDWEVYSQVTALCIGNAKY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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